24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3760  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

glcaihong

银虫 (正式写手)

[求助] 如何画有机分子结构式的长方体模型,得到分子的长宽高 已有1人参与

各位大侠,我想知道如何画出一个有机分子结构的长方体模型,我用chem 3D 画出结构式的填充模式或球棍模式之后,想知道它的长宽高,想知道分子的大小。
有文献说要把结构式放在长方体盒子里,X , Y, Z 尽可能保证Y 值最小,请教用什么软件,或什么方法能够得到分子的大小呢。
如图所示的那种。例如我想知道亚甲基蓝的分子大小,我可以通过chem 3D画出分子式,但怎么装到盒子里量出 X Y Z 呢?
这个问题困扰我很久了,希望能够得到你们的帮助,谢谢大家了!
如何画有机分子结构式的长方体模型,得到分子的长宽高
4.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

Alwaysdoyourbest,whatyouplantnow,youwillharvestlater.
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jimuwei

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by glcaihong at 2013-12-18 09:49:58
下面的连接打不开,
我只是想知道简单的数字,x y z 各是多少,目的是比较几个分子的大小,看看能不能通过一定形状尺寸的通道。而且上面的两个链接中很多软件我也没听过,当然更没有用过。所以只想通过简单的方法 ...

你是不是找一下晶体数据库,可能就有这些数据了。
Signalflag
6楼2013-12-27 13:09:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+3, 感谢指导! 2013-12-18 08:56:18
glcaihong: 金币+105, ★★★很有帮助, 学习了,可能我问的不是很明白,继续追问,感谢您的答复 2013-12-18 09:50:56
先搞清楚, 你要问的是什么
看看这里再回答
http://hi.baidu.com/sobereva/item/3c9a79cac80a397588ad9e6e
http://hi.baidu.com/sobereva/item/2707923863a0fd5b80f1a7df
如果你只是要一个简单的数字, 用Jmol很简单
http://www.shocksolution.com/201 ... unding-box-in-jmol/
2楼2013-12-17 23:35:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

glcaihong

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2013-12-17 23:35:50
先搞清楚, 你要问的是什么
看看这里再回答
http://hi.baidu.com/sobereva/item/3c9a79cac80a397588ad9e6e
http://hi.baidu.com/sobereva/item/2707923863a0fd5b80f1a7df
如果你只是要一个简单的数字, 用Jmol很简 ...

下面的连接打不开,
我只是想知道简单的数字,x y z 各是多少,目的是比较几个分子的大小,看看能不能通过一定形状尺寸的通道。而且上面的两个链接中很多软件我也没听过,当然更没有用过。所以只想通过简单的方法找到x y z 值。
当然圆柱形状的如果一起能够得到就更好的比较几个分子的大小了。
不知道我这样说是不是很清楚,谢谢您的回答。
Alwaysdoyourbest,whatyouplantnow,youwillharvestlater.
3楼2013-12-18 09:49:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jerkwin

专家顾问 (正式写手)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-19 12:31:09
引用回帖:
3楼: Originally posted by glcaihong at 2013-12-18 09:49:58
下面的连接打不开,
我只是想知道简单的数字,x y z 各是多少,目的是比较几个分子的大小,看看能不能通过一定形状尺寸的通道。而且上面的两个链接中很多软件我也没听过,当然更没有用过。所以只想通过简单的方法 ...

中国的墙啊, 不知要到什么时候.
打不开的链接看附件吧

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : FindingdimensionsofaboundingboxinJmol.pdf
  • 2013-12-18 10:10:10, 304.16 K

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-12-18 10:09:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 278求调剂 +27 范婷娜 2026-04-07 31/1550 2026-04-09 20:49 by zhouxiaoyu
[考研] 085402通信工程调剂,有4项学科竞赛国奖(电赛国二),硕士研究生调剂自荐信。 +3 m永o不v言o弃m 2026-04-09 3/150 2026-04-09 17:17 by 紫曦紫棋
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +19 慕绝cc 2026-04-09 23/1150 2026-04-09 17:14 by 段伟艳
[考研] 材料295 +15 小英11 2026-04-03 16/800 2026-04-09 15:44 by only周
[考研] 368化学求调剂 +13 wwwwabcde 2026-04-07 14/700 2026-04-09 14:47 by heaven_jay
[考研] 化学调剂求助 +14 LULONG1 2026-04-03 19/950 2026-04-09 10:43 by chenxi233
[考研] 308求调剂 +17 墨墨漠 2026-04-06 17/850 2026-04-09 09:25 by 壹往無前
[考研] 0703化学调剂 348分 +14 唉我超真没招了 2026-04-06 15/750 2026-04-08 19:16 by 我减肥1
[考研] 304求调剂(085602,过四级,一志愿985) +25 化工人999 2026-04-04 26/1300 2026-04-07 22:06 by hemengdong
[考研] 328求调剂 +4 ghhh88888 2026-04-06 5/250 2026-04-07 14:45 by ghhh88888
[考研] 302分求调剂 一志愿安徽大学085601 +12 zyx上岸! 2026-04-04 12/600 2026-04-07 02:09 by BruceLiu320
[考研] 285求调剂 +15 哦呦呼o 2026-04-04 17/850 2026-04-06 23:02 by chenzhimin
[硕博家园] 0856材料化工求调剂,一志愿211,初试成绩349 +4 江淮北月 2026-04-05 4/200 2026-04-06 22:44 by chenzhimin
[考研] 材料专硕322分 +10 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-04 10/500 2026-04-05 21:22 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +7 张.1 2026-04-05 7/350 2026-04-05 20:40 by 啵啵啵0119
[考研] 327求调剂 +4 拾光任染 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:16 by 南航~万老师
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +6 cs0106 2026-04-03 6/300 2026-04-04 11:20 by w_xuqing
[考研] 本9一志愿2 0854低分专硕286求调剂 +9 芒种111 2026-04-04 9/450 2026-04-04 11:01 by tangruihua
[考研] 317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂 +6 YinTai 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:30 by 无际的草原
[考研] 283求调剂 +3 jiouuu 2026-04-03 4/200 2026-04-03 13:28 by jiouuu
信息提示
请填处理意见