24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3742  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

glcaihong

银虫 (正式写手)

[求助] 如何画有机分子结构式的长方体模型,得到分子的长宽高 已有1人参与

各位大侠,我想知道如何画出一个有机分子结构的长方体模型,我用chem 3D 画出结构式的填充模式或球棍模式之后,想知道它的长宽高,想知道分子的大小。
有文献说要把结构式放在长方体盒子里,X , Y, Z 尽可能保证Y 值最小,请教用什么软件,或什么方法能够得到分子的大小呢。
如图所示的那种。例如我想知道亚甲基蓝的分子大小,我可以通过chem 3D画出分子式,但怎么装到盒子里量出 X Y Z 呢?
这个问题困扰我很久了,希望能够得到你们的帮助,谢谢大家了!
如何画有机分子结构式的长方体模型,得到分子的长宽高
4.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

Alwaysdoyourbest,whatyouplantnow,youwillharvestlater.
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jerkwin

专家顾问 (正式写手)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-19 12:31:09
引用回帖:
3楼: Originally posted by glcaihong at 2013-12-18 09:49:58
下面的连接打不开,
我只是想知道简单的数字,x y z 各是多少,目的是比较几个分子的大小,看看能不能通过一定形状尺寸的通道。而且上面的两个链接中很多软件我也没听过,当然更没有用过。所以只想通过简单的方法 ...

中国的墙啊, 不知要到什么时候.
打不开的链接看附件吧

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : FindingdimensionsofaboundingboxinJmol.pdf
  • 2013-12-18 10:10:10, 304.16 K

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-12-18 10:09:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+3, 感谢指导! 2013-12-18 08:56:18
glcaihong: 金币+105, ★★★很有帮助, 学习了,可能我问的不是很明白,继续追问,感谢您的答复 2013-12-18 09:50:56
先搞清楚, 你要问的是什么
看看这里再回答
http://hi.baidu.com/sobereva/item/3c9a79cac80a397588ad9e6e
http://hi.baidu.com/sobereva/item/2707923863a0fd5b80f1a7df
如果你只是要一个简单的数字, 用Jmol很简单
http://www.shocksolution.com/201 ... unding-box-in-jmol/
2楼2013-12-17 23:35:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

glcaihong

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2013-12-17 23:35:50
先搞清楚, 你要问的是什么
看看这里再回答
http://hi.baidu.com/sobereva/item/3c9a79cac80a397588ad9e6e
http://hi.baidu.com/sobereva/item/2707923863a0fd5b80f1a7df
如果你只是要一个简单的数字, 用Jmol很简 ...

下面的连接打不开,
我只是想知道简单的数字,x y z 各是多少,目的是比较几个分子的大小,看看能不能通过一定形状尺寸的通道。而且上面的两个链接中很多软件我也没听过,当然更没有用过。所以只想通过简单的方法找到x y z 值。
当然圆柱形状的如果一起能够得到就更好的比较几个分子的大小了。
不知道我这样说是不是很清楚,谢谢您的回答。
Alwaysdoyourbest,whatyouplantnow,youwillharvestlater.
3楼2013-12-18 09:49:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

glcaihong

银虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by jerkwin at 2013-12-18 10:09:09
中国的墙啊, 不知要到什么时候.
打不开的链接看附件吧...

非常感谢,我先试试,如果有问题再向您请教!
Alwaysdoyourbest,whatyouplantnow,youwillharvestlater.
5楼2013-12-18 10:18:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 331求调剂 +3 luoxin0706. 2026-04-08 3/150 2026-04-08 17:20 by -迷了路啊路
[考研] 269求调剂 +5 啊啊我我 2026-04-07 5/250 2026-04-08 16:06 by sunhuadong
[考研] 材料调剂 +19 一样YWY 2026-04-02 20/1000 2026-04-08 11:02 by 不吃魚的貓
[考研] 调剂 +3 电气300求调剂不 2026-04-08 6/300 2026-04-08 09:39 by 电气300求调剂不
[考研] 计算机408|在校多次国家级竞赛获奖|申请调剂 +4 东山大白鹅 2026-04-05 4/200 2026-04-08 00:18 by chongya
[考研] 305求调剂 +3 77Qi 2026-04-07 3/150 2026-04-07 23:18 by jp9609
[考研] 306求调剂 +3 15287505595 2026-04-03 3/150 2026-04-07 18:08 by 蓝云思雨
[考研] 307求调剂 +3 Youth@@ 2026-04-07 3/150 2026-04-07 09:25 by 小黑不怕难
[考研] 考研调剂 +7 15615482637 2026-04-04 7/350 2026-04-06 22:56 by chenzhimin
[考研] 考研调剂 +3 Wwwwwww哇 2026-04-06 3/150 2026-04-06 20:55 by lbsjt
[考研] 一志愿西北农林畜牧专硕336分求调剂 +3 5ourr 2026-04-03 3/150 2026-04-05 10:40 by JOKER0401
[考研] 278求调剂 +14 范婷娜 2026-04-04 15/750 2026-04-04 22:15 by lqwchd
[考研] 材料与化工306分找调剂 +23 沧海轻舟e 2026-04-02 27/1350 2026-04-04 21:52 by laoshidan
[考研] 一志愿上海大学生物学346 +3 上海大学346调剂 2026-04-03 3/150 2026-04-04 20:20 by dongzh2009
[考研] 一志愿沪9,求生物学调剂,326分 +6 刘墨墨 2026-04-04 6/300 2026-04-04 19:44 by 唐沐儿
[考研] 本9一志愿2 0854低分专硕286求调剂 +9 芒种111 2026-04-04 9/450 2026-04-04 11:01 by tangruihua
[考研] 求调剂,一志愿南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕 +10 @taotao 2026-04-03 10/500 2026-04-04 09:01 by T可可西里T
[考研] 一志愿重庆大学085404,总分314分,求调剂 +4 zf83hn 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:25 by 啵啵啵0119
[考研] 求调剂22408 288分 +5 new382 2026-04-02 5/250 2026-04-03 09:13 by 醉在风里
[考研] 一志愿北京科技大学085601材料工程英一数二初试总分335求调剂 +8 双马尾痞老板2 2026-04-02 9/450 2026-04-02 14:45 by 5896
信息提示
请填处理意见