24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3577  |  回复: 14

清风染翠

金虫 (小有名气)

[求助] 液体粘度的计算 已有2人参与

最近在用MD模拟计算一种液体的粘度,使用fortran编的程序,模拟区域是一个长方体,总共有4096个粒子,三个方向都是周期边界,通过热浴保持体系温度恒定。用Green-Kubo公式计算粘度。模拟的参数都按照文献中给定的,所以我是在复现文献中的结果。但是遇到一个问题。

粘度的积分步数在一万步时,得到的结果与文献中符合很好,当积分步数小于十万步时,结果看起来还可以,但是积分步数在100万步时,结果看起来是要发散的样子,而且不同次模拟得到的100万步图像是不宜氧的,为什么积分步数一长就无法保持结果的收敛和稳定性,有没有人做过或者有什么看法的可以交流一下。
液体粘度的计算
1万.png


液体粘度的计算-1
10万.png


液体粘度的计算-2
100万.png



[ Last edited by 清风染翠 on 2013-12-16 at 14:16 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MD分子动力学 动力学或热力学计算

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
清风染翠: 金币+50, ★★★很有帮助 2013-12-17 17:01:58
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2013-12-18 08:56:53
时间长的话噪音会有些大,可能只需积分到某个时间就可以了。

这篇文章里谈到了这个问题:http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp211952y
如果想进一步研究的话这篇文章的参考文献可能讲的更详细一些。
2楼2013-12-17 10:03:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

清风染翠

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zlf9452006 at 2013-12-17 12:38:59
个人认为是由周期性设置引起的。GK方法本来就是由宏观过程推导出来的,加之其本身信噪比极低,其涨落大是必然的。模拟中的周期性在宏观上导致了液体性质在个别方面的显著变化。
建议楼主考虑下非平衡方法,要稳定很 ...

直观上的理解应该是积分步数越多,波动越小,越趋于恒定值。我的三个方向边界都有差不多10个纳米,周期性边界会影星很大吗?非平衡方法已经算过了,就是用couette流算剪切力,现在就是想用Green-Kubo或者Einstein公式计算一遍
6楼2013-12-17 17:09:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

清风染翠

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2013-12-17 10:03:56
时间长的话噪音会有些大,可能只需积分到某个时间就可以了。

这篇文章里谈到了这个问题:http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp211952y
如果想进一步研究的话这篇文章的参考文献可能讲的更详细一些。...

我找到相关文献了,和你说的差不多,谢了.
3楼2013-12-17 11:17:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zlf9452006

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
清风染翠: 金币+30, ★★★很有帮助 2013-12-17 17:02:07
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-18 08:57:07
个人认为是由周期性设置引起的。GK方法本来就是由宏观过程推导出来的,加之其本身信噪比极低,其涨落大是必然的。模拟中的周期性在宏观上导致了液体性质在个别方面的显著变化。
建议楼主考虑下非平衡方法,要稳定很多,也要准确得多。
4楼2013-12-17 12:38:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

清风染翠

金虫 (小有名气)

直观上的理解应该是积分步数越多,波动越小,越趋于恒定值。我的三个方向边界都有差不多10个纳米,周期性边界会影星很大吗?非平衡方法已经算过了,就是用couette流算剪切力,现在就是想用Green-Kubo或者Einstein公式计算一遍。
5楼2013-12-17 17:09:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zlf9452006

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 清风染翠 at 2013-12-17 17:09:24
直观上的理解应该是积分步数越多,波动越小,越趋于恒定值。我的三个方向边界都有差不多10个纳米,周期性边界会影星很大吗?非平衡方法已经算过了,就是用couette流算剪切力,现在就是想用Green-Kubo或者Einstein公 ...

你可以用一系列不同大小的盒子跑下,看看能不能找到规律

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2013-12-18 04:36:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sciencejoy

新虫 (著名写手)

你跑平衡了吗?
8楼2013-12-18 11:15:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

清风染翠

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by sciencejoy at 2013-12-18 11:15:09
你跑平衡了吗?

肯定平衡了,宏观上的速度温度应力张量都收敛了
9楼2013-12-18 13:17:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qdykswang

金虫 (著名写手)

是不是步长太大了?减小步长试试发散的步数是否有变化.
化学工程+高分子
10楼2013-12-19 07:23:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 清风染翠 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上5B能上会吗? +4 redcom 2026-03-29 4/200 2026-03-29 17:39 by 最爱编纂辞典
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +7 李李不服输 2026-03-26 7/350 2026-03-29 16:25 by 学员8dgXkO
[考研] 材料学硕333求调剂 +11 北道巷 2026-03-24 11/550 2026-03-29 08:31 by fmesaito
[考研] 289求调剂 +13 新时代材料 2026-03-27 13/650 2026-03-29 01:16 by 544594351
[考研] 学硕274求调剂 +9 Li李鱼 2026-03-26 9/450 2026-03-28 21:42 by bymhappy
[考研] 315求调剂 +4 akie... 2026-03-28 5/250 2026-03-28 21:05 by zhq0425
[考研] 085600,材料与化工321分求调剂 +9 大馋小子 2026-03-28 9/450 2026-03-28 14:56 by 神马都不懂
[考研] 299求调剂 +7 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 7/350 2026-03-28 13:09 by 唐沐儿
[考研] 311求调剂 +9 lin0039 2026-03-26 9/450 2026-03-28 13:05 by 唐沐儿
[考研] 283求调剂 +7 A child 2026-03-28 7/350 2026-03-28 12:05 by zllcz
[考研] 材料277求调剂 +7 min3 2026-03-24 7/350 2026-03-28 11:39 by xuxiang
[考研] 340求调剂 +5 jhx777 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:18 by fmesaito
[考研] 265求调剂 +8 小木虫085600 2026-03-27 8/400 2026-03-27 22:16 by 无际的草原
[考研] 0703化学求调剂,各位老师看看我!!! +5 祁祺祺 2026-03-25 5/250 2026-03-27 21:44 by 东方猪猪
[考研] 求调剂 +4 零八# 2026-03-27 4/200 2026-03-27 18:07 by yu221
[考研] 一志愿郑大085600,310分求调剂 +5 李潇可 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:14 by 不吃魚的貓
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-03-26 4/200 2026-03-27 08:04 by chemisry
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856材料化工 | GPA 4.07 | 有科研经历 +6 cccchenso 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:25 by 544594351
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
信息提示
请填处理意见