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液体粘度的计算 已有2人参与
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最近在用MD模拟计算一种液体的粘度，使用fortran编的程序，模拟区域是一个长方体，总共有4096个粒子，三个方向都是周期边界，通过热浴保持体系温度恒定。用Green-Kubo公式计算粘度。模拟的参数都按照文献中给定的，所以我是在复现文献中的结果。但是遇到一个问题。 粘度的积分步数在一万步时，得到的结果与文献中符合很好，当积分步数小于十万步时，结果看起来还可以，但是积分步数在100万步时，结果看起来是要发散的样子，而且不同次模拟得到的100万步图像是不宜氧的，为什么积分步数一长就无法保持结果的收敛和稳定性，有没有人做过或者有什么看法的可以交流一下。  1万.png  10万.png  100万.png [ Last edited by 清风染翠 on 2013-12-16 at 14:16 ] |
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 MD分子动力学 | 动力学或热力学计算 |
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3楼2013-12-17 11:17:11
lsloneil
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【答案】应助回帖
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时间长的话噪音会有些大，可能只需积分到某个时间就可以了。 这篇文章里谈到了这个问题：http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp211952y 如果想进一步研究的话这篇文章的参考文献可能讲的更详细一些。 |
2楼2013-12-17 10:03:56
zlf9452006
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