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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zhucj82

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 求助:关于rTaq和LA Taq酶的

我要扩增3400bp的目的基因用于克隆,用的rTaq一次都没扩增出来过,想换LAtaq,可不知LA Taq使用时Mg、dNTP、酶、buffer的用量,还有程序是否与rTaq一样:
94度,5min
94度,1min
65度,1min
72度,4min
30cycles
72度,15min
请高手们帮帮忙,感激不尽!实在是做的太郁闷了!
奖励金币10个!
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freshair33

谢谢帮助
我两条引物的Tm值分别是63和65度,我实际做用过55,57,59度,都没扩出来。
楼上的是说LA Taq的延伸速度是15~30s/kb吗?跟rTaq相差挺远的啊
4楼2007-12-31 12:28:48
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Airare

金虫 (正式写手)

虫游天下

★ ★
谷峰(金币+2,VIP+0):谢谢!!!!
用普通Taq既然一次都扩增不出来,程序本来就不好了吧。酶的保真性还是很重要的,特别是你要的基因又比较大,所以就应该用高保真酶。以前做扩不出来,换了酶,原程序也可做的出来,不过你的原程序嘛~
LA Taq 还是不错的选择,条件还得摸一下。顺便说一下,做的好的话,循环数20-25就行了,以免突变,得不偿失~
——穿越死亡之门,到我这里来,虽则梦想褪色,岁月集成的果实腐烂掉,但我是永恒的真理,你将再会见我,在你从此岸渡向彼岸的生命航程中...
2楼2007-12-30 12:41:57
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dearmarie

铁虫 (初入文坛)


reasonspare(金币+1,VIP+0):欢迎交流
3400bp确实应该用LATaq,rTaq扩两千以下的,多了就不行了。关于反应体系,参考说明书的推荐体系,有两种buffer,买的时候问清楚,普通的buffer以及GC buffer,根据你的GC含量而定。你的反应条件中退火温度似乎较高,是因为引物的Tm值就设计的很高吗,可以降低些,或做个梯度试试,延伸时间按15~30s/kb即可。
3楼2007-12-30 20:57:52
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dearmarie

铁虫 (初入文坛)


johnsooh(金币+1,VIP+0):thx
我说的是用LA Taq时延伸时间的设定依据扩增子长度来计算。
你这样的引物Tm值,当然应该往低的温度试,65显然不行,还有,你是用rTaq试的,那不成功很正常。改用LA再试试,降低退火温度,三千多不算难扩的。
5楼2007-12-31 20:36:54
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