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有没有会做啊 ？我想死的心都有了啊。。。DNA酶切模拟软件。基因三维结构观察等等 已有1人参与
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Sample Text 利用软件模拟该基因酶切后的电泳情况，查找该基因是否有已知的三维结构数据，并下载该结构文件，用相关软件观察，分析该蛋白有无MHC-I类和II类分子的结合多肽序列。 |
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hl16010921
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
chin_jl: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-12-15 21:26:16
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1.lZ想要的是蛋白的三维结构数据吧，http://www.rcsb.org/上有蛋白的三维结构。 2.短肽类一般不具有典型的三维结构。构象是多个结构。蛋白的片段有时不具备稳定的三级结构。 3.MHC分子理论上能递呈所有的长度合适的肽段吧，所以LZ要如何判断结合序列呢？难道计算非递呈的肽和MHC的结合？ 4.由于MHC多态性的存在，总不能将某一MHC分子作为标准进行计算吧，如何选择MHC分子呢？不明觉厉。  还望指教。 |
2楼2013-12-13 15:36:55
3楼2013-12-15 21:27:55
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我按记忆大致说说吧，可能有小错误 。MHC可以认为是一类递呈抗原的蛋白，1类递呈降解的蛋白片段（包括病毒的蛋白），二类是由抗原递呈细胞递呈的肽段。一般MHC都有一个结合肽段的肽槽，在抗原递呈过程中抗原肽倍封闭到肽槽中，MHC可以同T细胞的TCR识别，形成类似夹心结构的抗原肽复合物。抗原肽长度在8到12肽左右，理论上MHC能递呈全部的多肽。同时MHC具有高度的多样性，无亲缘关系的MHC相容的概率在百万分之一左右（此数记不清了，你查查百度）所以可以认为每个个体的MHC的结构都是有区别的，而且每个蛋白片段都能被递呈，这作业咋做呀。MHC和抗原肽的结合有偏好性，可能从者方面下手吧，计算至少也给个大概的理论模型呀 |
4楼2013-12-16 09:51:10
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