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hahayou36532

铁虫 (小有名气)

[求助] 从乳酸菌筛选以及基因克隆阿魏酸酯酶

大神们,我有一个问题,如何用基因工程的方法从乳酸杆菌中克隆出阿魏酸酯酶?大概从下面四个步骤来做,
1、确定目的基因(包括乳酸菌菌种)
2、选择载体
3、确定受体细胞转化培养条件
4、筛选阳性菌落
可否说下四步你的具体如何展开,试剂的用量这些细枝末节没必要说明,主要求一下思路。。。

另外确定目的基因除了试剂盒法还有什么好方法吗?
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开心就好
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hahayou36532

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 屿iland at 2013-12-11 10:57:26
非专业建议
1.利用生物信息学手段查找乳酸杆菌基因组,数据库中应该会有阿魏酸酯酶的编码基因,以及会注释该基因组是哪种乳酸杆菌的,酶切下来即可,要是无法酶切就全合成吧,合成一个碱基貌似1块大洋的样 ...

谢谢大神。有不懂得再问你可以吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
开心就好
3楼2013-12-11 12:58:53
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屿iland

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-12-12 15:37:35
非专业建议
1.利用生物信息学手段查找乳酸杆菌基因组,数据库中应该会有阿魏酸酯酶的编码基因,以及会注释该基因组是哪种乳酸杆菌的,酶切下来即可,要是无法酶切就全合成吧,合成一个碱基貌似1块大洋的样子,然后pcr
2.利用带有抗性的质粒进行克隆,可以将其转入大肠杆菌(是感受态的哦,亲)中去,先选抗性质粒,酶切后将目的基因连接上,我们实验室常用大肠感受态,先逐步升温解冻复活,然后冷激再热激等等
3.让后平板划线,挑单菌落,摇瓶放大一批,提质粒,测序确定得到的大肠是含有目的片段的,若测序结果是对的,那么你就可以再进一步扩大,同时要留一些做菌种进行保存。

不知对不对,我也还没做实验,全凭主观臆断的
2楼2013-12-11 10:57:26
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屿iland

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hahayou36532 at 2013-12-11 12:58:53
谢谢大神。有不懂得再问你可以吗?
...

ok
4楼2013-12-11 13:35:29
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hahayou36532

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 屿iland at 2013-12-11 13:35:29
ok...

大神,我在NCBI中的gene类下输入ferulicacidesterase(阿魏酸酯酶),然后怎么找基因序列呢?还有设计引物呢。。。
开心就好
5楼2013-12-11 23:18:14
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