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zlin

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[求助] 求助绘制插层化合物(Mg0.667Al0.333) (OH)2 (CO3)0.167(H2O)0.5的晶体图

各位大神,能否帮忙绘制插层化合物(Mg0.667Al0.333) (OH)2 (CO3)0.167(H2O)0.5的晶体图,下面是这个晶体的XRD的数据, 能否帮忙绘制如下图的晶体结构图。小弟用Crystalmaker弄了一下午了,都没有做出来,麻烦各位大神帮忙。可以追加金币奖励!

这是XRD的卡片数据
PDF#89-0460: QM=Calculated; d=Calculated; I=Calculated
Hydrotalcite, syn
( Mg0.667 Al0.333 ) ( O H )2 ( C O3 )0.167 ( H2 O )0.5       
Radiation=CuKa1        Lambda=1.54060        Filter=
Calibration=        d-Cutoff=17.7        I/Ic(RIR)=2.41
Ref= Calculated from ICSD using POWD-12++

Rhombohedral - Powder Diffraction,  R-3m (166)        Z=3        mp=
Cell=3.046x22.772        Pearson=hR7.17 (?)
Density(c)=2.129        Density(m)=2.11A        Mwt=78.24        Vol=182.97        F(30)=999.9(.0000,30)
Ref= Bellotto, M., Rebours, B., Clause, O., Lynch, J., Bazin, D., Elkaim, E.
J. Phys. Chem., 100 8527 (1996)
Strong Line: 7.59/X 3.80/3 2.57/2 1.93/2 2.28/2 1.49/1 1.52/1 1.72/1 1.63/1 1.46/1
FIZ=081963: X-ray diffraction (powder) Rietveld profile refinement applied ITF A reexamination of hydrotalcite crystal chemistry

d(A)     I(f)   I(v)  h  k   l  n^2  2-Theta   Theta  1/(2d)   2pi/d  
7.590  100.0  100.0  0  0   3        11.648   5.824  0.0659  0.8278
3.795   31.6   63.3  0  0   6        23.420  11.710  0.1317  1.6555
2.620    0.9    2.6  1  0   1        34.190  17.095  0.1908  2.3978
2.569   20.5   60.7  0  1   2        34.884  17.442  0.1946  2.4450
2.530    1.4    4.2  0  0   9        35.448  17.724  0.1976  2.4833
2.393    0.1    0.3  1  0   4        37.547  18.773  0.2089  2.6251
2.282   17.9   59.6  0  1   5        39.443  19.721  0.2190  2.7526
2.048    0.1    0.4  1  0   7        44.165  22.082  0.2440  3.0666
1.934   20.5   80.5  0  1   8        46.920  23.460  0.2584  3.2474
1.897    0.5    2.0  0  0  12        47.896  23.948  0.2635  3.3110
1.723    4.6   20.3  1  0  10        53.085  26.542  0.2901  3.6450
1.628    3.1   14.4  0  1  11        56.456  28.228  0.3070  3.8581
1.523    5.5   27.4  1  1   0        60.764  30.382  0.3283  4.1255
1.518    2.9   14.5  0  0  15        60.980  30.490  0.3294  4.1388
1.493    5.9   30.0  1  1   3        62.108  31.054  0.3348  4.2078
1.459    2.1   10.9  1  0  13        63.721  31.861  0.3426  4.3057
1.413    1.9   10.2  1  1   6        66.045  33.022  0.3537  4.4453
1.384    1.2    6.6  0  1  14        67.608  33.804  0.3611  4.5382
1.316    0.2    1.2  0  2   1        71.604  35.802  0.3797  4.7717
1.310    0.6    3.5  2  0   2        72.018  36.009  0.3816  4.7956
1.304    0.2    1.2  1  1   9        72.360  36.180  0.3832  4.8153
1.284    0.1    0.6  0  2   4        73.665  36.832  0.3891  4.8899
1.266    1.6    9.6  2  0   5        74.891  37.445  0.3947  4.9595
1.265    0.7    4.2  0  0  18        75.015  37.507  0.3952  4.9665
1.252    2.1   12.7  1  0  16        75.898  37.949  0.3992  5.0162
1.222    0.2    1.2  0  2   7        78.127  39.064  0.4091  5.1404
1.196    1.1    7.0  2  0   8        80.130  40.065  0.4178  5.2503
1.194    0.6    3.8  0  1  17        80.321  40.161  0.4186  5.2607
1.187    0.1    0.6  1  1  12        80.858  40.429  0.4210  5.2899
1.141    0.3    2.0  0  2  10        84.892  42.446  0.4381  5.5051
1.112    0.6    4.1  2  0  11        87.651  43.826  0.4495  5.6485
1.091    0.3    2.1  1  0  19        89.807  44.903  0.4582  5.7582
求助绘制插层化合物(Mg0.667Al0.333) (OH)2 (CO3)0.167(H2O)0.5的晶体图
LDH-7.jpg


求助绘制插层化合物(Mg0.667Al0.333) (OH)2 (CO3)0.167(H2O)0.5的晶体图-1
LDH-6.jpg
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休眠火山

禁虫 (知名作家)

XRD&SEM qq2978260443


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
zlin: 金币+100, ★★★很有帮助, 非常感谢您,能否将这个源文件发给我,或者转换一下格式发给我? 2013-12-13 13:57:31
lijunjie84: 回帖置顶 2013-12-14 13:45:00
试了下,看看有没有帮助

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  • 附件 1 : 81963.bmp
  • 2013-12-13 09:54:46, 3.75 M
21楼2013-12-13 09:55:32
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sevenstar90

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
zlin: 金币+130, ★★★很有帮助, 非常感谢,请问怎么缩小啊,现在这个显示的太大了,我看不到全部,但是我zoom in之后没有效果啊 2013-12-13 21:41:34
lijunjie84: 回帖置顶 2013-12-14 13:44:50

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  • 附件 1 : (Mg0.667Al0.333)(OH)2(CO3)0.167(H2O)0.5-2.diamdoc
  • 2013-12-13 21:27:47, 81.4 K
29楼2013-12-13 21:28:31
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sevenstar90

木虫 (小有名气)

引用回帖:
31楼: Originally posted by zlin at 2013-12-13 21:49:15
我这里diamond的是3.2版本,不能缩放,不知道怎么回事。
附件中是我保存的图片,不能显示全部,能否告诉一下是什么原因呢,非常感谢~

Copy of (Mg0.667Al0.333) (OH)2 (CO3)0 拷贝.jpg
...

我的diamond 版本也是3.2的,
1. 想要设置适当的大小来保存为图片格式,可以使用picture-layout-bitmap, 然后修改分辨率DPI(dot per inch)参数和图片大小width 和 height。
2. 投射效果(就是近大远小的实际观察效果),可以调节representation-projection里面的选择central,调整下面两个参数。

附件中有源文件和另存为的图片

PS:万一在左下角出现了一个“J”的标志,说明原子超出了版面,可以用Enlargement factor调整以适应版面大小。

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32楼2013-12-13 22:47:58
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phoenix012

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zlin at 2013-12-10 15:44:51
顶~

data for   ICSD #81963
Coll Code   81963
Rec  Date   1999/11/30
Chem Name   Magnesium Aluminium Hydroxide Carbonate Hydrate
            (0.67/0.33/2/0.17/0.5)
Structured  (Mg0.667 Al0.333) (O H)2 (C O3)0.167 (H2 O)0.5
Sum         C0.167 H3 Al0.333 Mg0.667 O3.001
ANX         AB6X18
Min Name    Hydrotalcite
D(calc)     2.13
Title       A reexamination of hydrotalcite crystal chemistry
Author(s)   Bellotto, M.;Rebours, B.;Clause, O.;Lynch, J.;Bazin, D.;Elkaim, E.
Reference   Journal of Physical Chemistry
            (1996), 100, 8527-8534
Unit Cell   3.0460(1) 3.0460(1) 22.7720(20) 90. 90. 120.
Vol         182.98
Z           3
Space Group R -3 m H
SG Number   166
Cryst Sys   trigonal/rhombohedral
Pearson     hR7
Wyckoff     h c2 a
R Value     0.089
Red Cell    RH 3.046 3.046 7.791 78.728 78.728 60 60.992
Trans Red   1.000 0.000 0.000 / 1.000 1.000 0.000 / 0.667 0.333 0.333
Comments    Compound with mineral name: Hydrotalcite
            The structure has been assigned a PDF number (calculated
            powder diffraction data): 01-089-0460
            Rietveld profile refinement applied
            Temperature factors available
            Structure type : Hydrotalcite
            X-ray diffraction (powder)
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H        ITF(U)   
Mg   1  +2    3 a   0           0           0              0.667      0       0.0227(5)
Al   1  +3    3 a   0           0           0              0.333      0       0.0227(5)
O    1  -2    6 c   0           0           0.37634(9)     1.         0       0.0385(8)
H    1  +1    6 c   0           0           0.418(1)       1.         0        0.084(7)
O    2  -2    18 h  0.1058(7)   0.8942(7)   0.5            0.1667     0        0.029(2)
C    1  +4    6 c   0.3333      0.6667      0.5            0.0833     0        0.084(7)
H    2  +1    6 c   0.3333      0.6667      0.5            0.5        0        0.084(7)
Std. Notes  Transformation Method: Tidy
Std. Cell   3.046 3.046 22.772 90 90 120
Std. Vol.   182.97
Std. Z      3
Std. SG     R3-MH
Std. Atom
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF     
Mg   1  +2    3 a   0           0           0              0.667     
Al   1  +3    3 a   0           0           0              0.333     
O    1  -2    6 c   0           0           .37634         1.        
H    1  +1    6 c   0           0           .41800         1.        
O    2  -2    18 h  .43913      .56087      .16667         0.166700  
C    1  +4    6 c   0           0           .16667         0.0833   
H    2  +1    6 c   0           0           .16667         0.5      
*end for    ICSD #81963
这是数据,我画画试试
4楼2013-12-10 18:15:57
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普通回帖

zlin

荣誉版主 (知名作家)

顶~
2楼2013-12-10 08:25:10
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zlin

荣誉版主 (知名作家)

顶~
3楼2013-12-10 15:44:51
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phoenix012

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
能说下这些多面体是谁和谁形成的吗
5楼2013-12-10 18:43:30
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zlin

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优秀版主

引用回帖:
4楼: Originally posted by phoenix012 at 2013-12-10 18:15:57
data for   ICSD #81963
Coll Code   81963
Rec  Date   1999/11/30
Chem Name   Magnesium Aluminium Hydroxide Carbonate Hydrate
            (0.67/0.33/2/0.17/0.5)
Structured  (Mg0.667 Al0.333) (O  ...

非常感谢您~
只有初恋般的热情和宗教般的意志,人才有可能成就某种事业——路遥
6楼2013-12-10 22:41:52
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zlin

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引用回帖:
5楼: Originally posted by phoenix012 at 2013-12-10 18:43:30
能说下这些多面体是谁和谁形成的吗

应该是Al与O形成氧化物,Mg与O形成氧化物,明天我在确认一下~
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7楼2013-12-10 22:43:27
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zlin

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引用回帖:
5楼: Originally posted by phoenix012 at 2013-12-10 18:43:30
能说下这些多面体是谁和谁形成的吗

您好,我这里找了一下百度百科的描述,你看对不对
“LDHs是由带正电荷的主体层板和层间阴离子通过非共价键的相互作用组装而成化合物,它的结构类似于水镁石Mg(OH)2,由MgO6八面体共用棱形成单元层。有以下几个很突出的特点:(1)主体层板的化学组成可调变;(2)层间客体阴离子的种类和数量可调变;(3)插层组装体的粒径尺寸和分布可调控
典型的LDHs化合物是镁铝碳酸根型水滑石:Mg6Al2(OH)16·4H2O[4]。LDHs的结构非常类似于水镁石[Mg(OH)2],由MgO6八面体共用棱形成单元层,位于层上的Mg2+可在一定的范围内被Al3+同晶取代,使得层板带正电荷,层间有可交换的CO32-与层板上的正电荷平衡,使得LDHs的整体结构呈电中性。由于层板和层间阴离子通过氢键连接,使得LDHs层间阴离子具有可交换性。此外,在LDHs中存在层间水这些水分子可以在不破坏层状结构条件下除去。”
这是链接:
http://baike.baidu.com/link?url= ... dDm2c61W6WIg6jyBEuK
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8楼2013-12-11 10:11:36
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zlin

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引用回帖:
5楼: Originally posted by phoenix012 at 2013-12-10 18:43:30
能说下这些多面体是谁和谁形成的吗

LDHs的层板由镁八面体和铝氧八面体组成。所以,具有较强的碱性[5]。不同的LDHs的碱性强弱与组成中二价金属氢氧化物的碱性强弱基本一致,但由于它一般具有很小的比表面积(约5—20m2/g),表观碱性较小,其较强的碱性往往在其煅烧产物LDO中表现出来。LDO一般具有较高的比表面积(约200—300m2/g)、三种强度不同的碱中心和不同的酸中心,其结构中间中心充分暴露,使其具有比LDH更强的碱性。

这是另外一种描述,不知道哪种对,不过我倾向这种描述比较对。
只有初恋般的热情和宗教般的意志,人才有可能成就某种事业——路遥
9楼2013-12-11 10:13:45
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zlin

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引用回帖:
5楼: Originally posted by phoenix012 at 2013-12-10 18:43:30
能说下这些多面体是谁和谁形成的吗

请问您是用crystalmaker绘制的吗?能否绘制之后将源文件发给我,我也来学习一下。非常感谢您~
只有初恋般的热情和宗教般的意志,人才有可能成就某种事业——路遥
10楼2013-12-11 10:17:48
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