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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 提取环境宏基因组DNA用革兰氏阳性菌裂解液处理样品对革兰氏阴性菌有影响吗
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annaatobe

银虫 (初入文坛)

[求助] 提取环境宏基因组DNA用革兰氏阳性菌裂解液处理样品对革兰氏阴性菌有影响吗

我做的是工厂设备表面环境样品微生物组宏基因组相关的实验，目前还不了解工厂里可能存在的细菌的种类。我最近在写实验方案细节，初始方案里给的试剂盒是GeneJET™ Genomic DNA purification kit (# K0722, 250 preps)， 我查了一下试剂盒手册，发现这个试剂盒提取分为革兰氏阳性菌和阴性菌，对于阳性菌要配制裂解液先行处理之后才能上试剂盒。
我想请问在这种情况下，我直接对样品使用革兰氏阳性菌裂解液进行处理，会对样品中的革兰氏阴性菌有影响吗？我想的是如果没有影响我就不换试剂盒了，如果有影响我得再查查文献换种试剂盒。之所以实验室里选择这个试剂盒是因为这是目前实验室里现成的试剂盒。
顺带想问下坛子里的各位，能否推荐一些各位用起来感觉不错的宏基因组提取试剂盒呢？我之前搜索论坛里，感觉好多推荐的都是土壤样品DNA提取试剂盒，就想在这个帖子里顺便问一句。
谢谢各位！！！
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1楼 2013-11-30 01:43:17
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缘来是伊

木虫 (小有名气)
你可以做2个大肠杆菌，一个按阳性菌处理一下，另一个不处理，提取后，对比一下，跑跑胶，测测浓度质量
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4楼2015-01-29 19:54:19
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yang0071

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
annaatobe: 金币+5 2013-12-01 06:29:59
你可以先用手头的试剂盒先试试;
同时 其他的先熟悉起来
还有  你就一个人吗? 其他的同事呢?
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2楼2013-11-30 06:29:51
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annaatobe

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yang0071 at 2013-11-30 06:29:51
你可以先用手头的试剂盒先试试;
同时 其他的先熟悉起来
还有  你就一个人吗? 其他的同事呢?

谢谢帮助，其实我的实验现在还没开始，手头没有样品。我主要是在写方案的过程中突然意识到了这个问题，所以想先到论坛上来问问。查询的时候也看到有人问了类似的问题，但是没有一个比较确切的答复。
谢谢~！
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3楼2013-11-30 21:20:03
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