[交流] lammps中change_box命令的使用,无法将模拟体系放在模拟盒子中间位置急求~!

在立方体的盒子中做完弛豫过程后,想在盒子的x方向上向正负两个方向各拉长一个距离75,使分子体系位于拉长后模拟盒子的中间位置,采用change_box命令
change_box all x delta -75 150 units box
但是完成后分子体系一直位于模拟盒子左端的位置,不能到中间,求高手指导!

jietu.png

回复此楼

» 猜你喜欢

请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。已经有4人回复
真诚求助：手里的省社科项目结项要求主持人一篇中文核心，有什么渠道能发核心吗已经有6人回复
孩子确诊有中度注意力缺陷已经有14人回复
三甲基碘化亚砜的氧化反应已经有4人回复
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢已经有5人回复
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗已经有5人回复
2025冷门绝学什么时候出结果已经有3人回复
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入已经有4人回复
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生已经有6人回复
AI论文写作工具：是科研加速器还是学术作弊器？已经有3人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

LAMMPS----compute coord/atom命令已经有11人回复
【讨论】lammps中利用velocity命令无法控制住速度问题已经有11人回复
【讨论】lammps中关于fix ave/spatial命令的输出问题已经有4人回复
【讨论】LAMMPS的replicate command与creat box区别已经有3人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:
查看全部散金贴

1楼2013-11-25 13:01:47

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

fengliu

铁杆木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 5772.5
帖子: 59
在线: 117.8小时
虫号: 1209758

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

楼主，能否说一下你是怎么解决的吗？谢谢。

赞一下

回复此楼

9楼2014-10-31 10:29:16

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 11 个回答

老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+3, 专家考核, 感谢指导！ 2014-02-14 15:09:47

你的命令不是两边各移动75，按照你的命令，你应该是左边界左移75，右边界右移150。你可对照Manual，看看生成的结果。

这种改变边界位置的事情，我一般不用这个命令。你弛豫过后，可以在文件末用write_data命令把构型写入一个文件，然后手工在文件上改，把xlo和xhi改成任何你要的数字，而坐标不变，然后存起来。然后写一个新的输入文件，用read_data命令把你改过的构型文件读进来。这是最保险的的作法了。也放心也不费事。

赞一下(1人)

回复此楼

3楼2013-11-28 09:39:19

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

tim562944200

金虫 (小有名气)

应助: 10 (幼儿园)
金币: 963.2
帖子: 210
在线: 100.5小时
虫号: 2525506

引用回帖:

3楼: Originally posted by 老虎大王 at 2013-11-28 09:39:19
你的命令不是两边各移动75，按照你的命令，你应该是左边界左移75，右边界右移150。你可对照Manual，看看生成的结果。

这种改变边界位置的事情，我一般不用这个命令。你弛豫过后，可以在文件末用write_data命令把 ...

谢谢回复,我一定会试一下你的方法,不过我弛豫过后用dis_change命令拉长了方向后接着开始模拟过程,会出现如下图片的问题,我个人理解是弛豫过后有些分子在边界上不完整造成的,不知道你的方法会不会有这样的问题? 也请教一下这样的问题如何解决?