24小时热门版块排行榜    

查看: 4372  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

tim562944200

金虫 (小有名气)


[交流] lammps中change_box命令的使用,无法将模拟体系放在模拟盒子中间位置 急求~!

在立方体的盒子中做完弛豫过程后,想在盒子的x方向上向正负两个方向各拉长一个距离75,使分子体系位于拉长后模拟盒子的中间位置,采用change_box命令
change_box          all x delta -75 150   units box
但是完成后分子体系一直位于模拟盒子左端的位置,不能到中间,求高手指导!
lammps中change_box命令的使用,无法将模拟体系放在模拟盒子中间位置  急求~!
jietu.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fengliu

铁杆木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,能否说一下你是怎么解决的吗?谢谢。
9楼2014-10-31 10:29:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+3, 专家考核, 感谢指导! 2014-02-14 15:09:47
你的命令不是两边各移动75,按照你的命令,你应该是左边界左移75,右边界右移150。你可对照Manual,看看生成的结果。

这种改变边界位置的事情,我一般不用这个命令。你弛豫过后,可以在文件末用write_data命令把构型写入一个文件,然后手工在文件上改,把xlo和xhi改成任何你要的数字,而坐标不变,然后存起来。然后写一个新的输入文件,用read_data命令把你改过的构型文件读进来。这是最保险的的作法了。也放心也不费事。
3楼2013-11-28 09:39:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tim562944200

金虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 老虎大王 at 2013-11-28 09:39:19
你的命令不是两边各移动75,按照你的命令,你应该是左边界左移75,右边界右移150。你可对照Manual,看看生成的结果。

这种改变边界位置的事情,我一般不用这个命令。你弛豫过后,可以在文件末用write_data命令把 ...

谢谢回复,我一定会试一下你的方法,不过我弛豫过后用dis_change命令拉长了方向后接着开始模拟过程,会出现如下图片的问题,我个人理解是弛豫过后有些分子在边界上不完整造成的,不知道你的方法会不会有这样的问题? 也请教一下这样的问题如何解决?
lammps中change_box命令的使用,无法将模拟体系放在模拟盒子中间位置  急求~!-1
2013-11-28 14:26:08的屏幕截图.png

4楼2013-11-28 14:32:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
好简单啊,把你的模拟体系整体平移一段不久行了。
从你的图上看,把所有的原子x坐标加上大概盒子长度的一半不就到中间了?
5楼2013-11-28 14:57:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +3 布布和一二 2026-08-10 3/150 2026-08-10 13:00 by smlz521
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +5 家与远方 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:45 by 家与远方
[基金申请] FileCode能看出啥? +3 要乐观耀哥 2026-08-10 6/300 2026-08-10 12:33 by 要乐观耀哥
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +9 yufeiwaner 2026-08-09 9/450 2026-08-10 12:25 by 流流伤
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +12 Lanmanbaby 2026-08-09 20/1000 2026-08-10 11:51 by 要乐观耀哥
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 好奇怪的filecode +3 布布和一二 2026-08-08 4/200 2026-08-08 17:46 by zhanghaozhu
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
请填处理意见