版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (3128)
>虫友互识 (256)
>导师招生 (209)
>文献求助 (139)
>休闲灌水 (131)
>教师之家 (90)
>考博 (85)
>基金申请 (77)
>论文投稿 (65)
>考研 (61)
>硕博家园 (52)
>找工作 (47)
>论文道贺祈福 (42)
>招聘信息布告栏 (39)
>博后之家 (39)
>公派出国 (18)

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

tim562944200

金虫 (小有名气)

应助: 10 (幼儿园)
金币: 963.2
帖子: 210
在线: 100.5小时
虫号: 2525506

[交流] lammps中change_box命令的使用,无法将模拟体系放在模拟盒子中间位置急求~!

在立方体的盒子中做完弛豫过程后,想在盒子的x方向上向正负两个方向各拉长一个距离75,使分子体系位于拉长后模拟盒子的中间位置,采用change_box命令
change_box all x delta -75 150 units box
但是完成后分子体系一直位于模拟盒子左端的位置,不能到中间,求高手指导!

jietu.png

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

LAMMPS----compute coord/atom命令已经有11人回复
【讨论】lammps中利用velocity命令无法控制住速度问题已经有11人回复
【讨论】lammps中关于fix ave/spatial命令的输出问题已经有4人回复
【讨论】LAMMPS的replicate command与creat box区别已经有3人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2013-11-25 13:01:47

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

tim562944200

金虫 (小有名气)

应助: 10 (幼儿园)
金币: 963.2
帖子: 210
在线: 100.5小时
虫号: 2525506

引用回帖:

5楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-11-28 14:57:42
好简单啊，把你的模拟体系整体平移一段不久行了。
从你的图上看，把所有的原子x坐标加上大概盒子长度的一半不就到中间了？

谢谢已经解决了

回复此楼

6楼2013-11-28 15:07:46

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 11 个回答

老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+3, 专家考核, 感谢指导！ 2014-02-14 15:09:47

你的命令不是两边各移动75，按照你的命令，你应该是左边界左移75，右边界右移150。你可对照Manual，看看生成的结果。

这种改变边界位置的事情，我一般不用这个命令。你弛豫过后，可以在文件末用write_data命令把构型写入一个文件，然后手工在文件上改，把xlo和xhi改成任何你要的数字，而坐标不变，然后存起来。然后写一个新的输入文件，用read_data命令把你改过的构型文件读进来。这是最保险的的作法了。也放心也不费事。

赞一下(1人)

回复此楼

3楼2013-11-28 09:39:19

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

tim562944200

金虫 (小有名气)

应助: 10 (幼儿园)
金币: 963.2
帖子: 210
在线: 100.5小时
虫号: 2525506

引用回帖:

3楼: Originally posted by 老虎大王 at 2013-11-28 09:39:19
你的命令不是两边各移动75，按照你的命令，你应该是左边界左移75，右边界右移150。你可对照Manual，看看生成的结果。

这种改变边界位置的事情，我一般不用这个命令。你弛豫过后，可以在文件末用write_data命令把 ...

谢谢回复,我一定会试一下你的方法,不过我弛豫过后用dis_change命令拉长了方向后接着开始模拟过程,会出现如下图片的问题,我个人理解是弛豫过后有些分子在边界上不完整造成的,不知道你的方法会不会有这样的问题? 也请教一下这样的问题如何解决?