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lammps弛豫过程
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| 大家好，最近才知道对一个体系在动力学模拟之前是应该用npt进行一次弛豫，也就是说我原本在ms建立的模型键长都是实验的理想键长，而在动力学模拟的时候由于我用的势函数发生了变化，不同的势函数体系中键长也是不一样的，所以还要npt还弛豫，这样的话我就遇到一个问题，npt弛豫过后模拟盒子的大小都变化了，我需要把弛豫过后的结构再一次转化成data文件，然后接着进行我所需要的性质的计算模拟，就是这个再次转换data文件我不知道怎么转换，在npt弛豫的过程中输出什么样的文件更容易转换？具体的转换过程是怎么样的？请大家帮帮忙呀，不甚感激…… |
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lsloneil
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Use 'write_data' command http://lammps.sandia.gov/doc/write_data.html Or you may convert your restart file to data file using 'restart2data' http://lammps.sandia.gov/doc/Section_tools.html#restart |
2楼2013-11-23 01:31:02