24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2380  |  回复: 12

lilei119

新虫 (正式写手)

[求助] 一个细菌测序后的基因与genbank里比对最大相似度只有90%,什么原因?

各位专家,刚接触微生物基因鉴定。有个问题请教:
我对一种藻类(原核)进行dna检测后,测序后的基因与genbank里比对最大相似度只有90%,而且有10几种都是90%,一般说要95%以上才能定性。不知道我们该如何进一步确定是哪个物种?谢谢各位。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

肥猫p

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lilei119: 金币+20, 4 2013-12-03 17:18:26
你是对哪个基因进行测序,itS区域吗?如果是某个功能性基因,那么同源度低是正常的
2楼2013-11-22 21:46:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lilei119

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 肥猫p at 2013-11-22 21:46:32
你是对哪个基因进行测序,itS区域吗?如果是某个功能性基因,那么同源度低是正常的

多谢回复。我做的应该是最基本的,16srna,
3楼2013-11-22 21:59:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

肥猫p

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lilei119 at 2013-11-22 21:59:03
多谢回复。我做的应该是最基本的,16srna,...

你用的是哪种通用引物?
4楼2013-11-22 22:02:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

圣迭戈

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
那就说明你得到的是新菌啊,抓住机会啊。另外你用的16S是多长的?全长吗?
5楼2013-11-22 22:12:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lilei119

新虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 圣迭戈 at 2013-11-22 22:12:11
那就说明你得到的是新菌啊,抓住机会啊。另外你用的16S是多长的?全长吗?

感谢回复。用的应该是细菌的引物,因为那个介绍我去做的同学是做细菌的。我这个蓝藻是原核生物,有时候也叫细菌。不过就算是一种新的细菌或者藻类,有什么机会呢?16s的长度我不知道,最后测出来的碱基书是1500多个。
6楼2013-11-22 22:40:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lilei119

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 肥猫p at 2013-11-22 22:02:26
你用的是哪种通用引物?...

感谢回复,我不知道是什么引物,可能是细菌的通用引物吧。可以这样做吗?
7楼2013-11-22 22:40:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼主的藻是新种吧

[ 发自小木虫客户端 ]
8楼2013-11-23 12:25:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lilei119

新虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by dllchina at 2013-11-23 12:25:52
楼主的藻是新种吧

多谢回复,其实我也想过是否是一种稍微新一点的藻,毕竟同一个藻在不同的区域长期下来可能真的会有变异。但是不知道如何表达或者维护这种发现。比如一些发明创造可以申请专利,类似这种应该如何做?是否有很大的意义?
9楼2013-11-23 12:34:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

肥猫p

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

通用引物也分很多种的。
我觉得就算是新种,也不会相似度只有90%吧?这也太低了。那都能算是新属了。
10楼2013-11-23 19:37:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lilei119 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿0807 数一英一 313 有没有二轮调剂 +7 emokidd 2026-04-08 7/350 2026-04-09 00:11 by Evan_Liu
[考研] 工科 267求调剂 +6 wanwan00 2026-04-02 8/400 2026-04-08 22:09 by 朱云虎202
[考研] 材料工程调剂 +8 小刘同学吖吖 2026-04-06 9/450 2026-04-08 19:35 by cheerful9622
[考研] 085600材料与化工301分求调剂院校 +27 刺痛jk 2026-04-06 28/1400 2026-04-08 16:16 by luoyongfeng
[考研] 化工学硕 285求调剂 +26 Wisjxn 2026-04-07 26/1300 2026-04-08 14:42 by screening
[考研] 电子信息346 +4 zuoshaodian 2026-04-08 4/200 2026-04-08 11:54 by zzucheup
[考研] 生物医药调剂|SCI中科院三区一作+多项科研成果 +8 likangxing 2026-04-07 11/550 2026-04-08 00:02 by lys0704
[考研] 材料工程专业日语生求调剂 +9 111623 2026-04-07 9/450 2026-04-07 23:31 by 一只好果子?
[考研] 315求调剂 +17 小羊小羊_ 2026-04-02 18/900 2026-04-07 22:01 by lijunpoly
[考研] 363求调剂 +9 zh096 2026-04-04 9/450 2026-04-07 21:51 by 418490947
[考研] 332求调剂 +17 小小孟... 2026-04-05 18/900 2026-04-06 09:51 by 蓝云思雨
[考研] 材料专硕283求调剂 +17 试试看呗 2026-04-04 18/900 2026-04-06 09:24 by 286640313
[考研] 材料与化工371求调剂 +14 陪琳看海 2026-04-04 15/750 2026-04-06 06:59 by houyaoxu
[考研] 考研调剂生寻找导师 +3 顾瞻考研啊 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:18 by 啵啵啵0119
[考研] 0860 求调剂 一志愿国科大 348 分 +3 WiiiP 2026-04-03 3/150 2026-04-05 17:43 by Ecowxq666!
[考研] 358求调剂 +7 秋gk 2026-04-04 7/350 2026-04-05 13:29 by huangmoli
[考研] 材料调剂 +12 一样YWY 2026-04-04 12/600 2026-04-05 08:24 by 544594351
[考研] 能动调剂326专硕 +4 wan112233 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:47 by yu221
[考研] 085701求调剂 +7 龚禹铭 2026-04-04 8/400 2026-04-04 13:49 by 小小树2024
[考研] 305求调剂 +3 77Qi 2026-04-03 3/150 2026-04-03 23:01 by qzxyhcsy
信息提示
请填处理意见