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如何查找启动子和顺式作用元件 已有22人参与
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最近要研究启动子的一些基序，总结出一些方法和大家分享。 1，首先明确你的元件序列，可以进入该网站，根据你的转录因子搜索相关反应元件的序列 首先快速搜索，例如查找雄激素受体（androgen receptor)的反应元件，输入androgen receptor  点击图片，就能进一步查看该顺式作用元件的序列及其他信息了 http://bcs.keyan.cc/emuchnet/201 ... _1384763423_366.jpg 2，启动子数据库TRED http://rulai.cshl.edu/cgi-bin/TRED/tred.cgi?process=home 可以在该网站查找基因启动子，可以检测启动子内潜在的元件。 例如，查找人的OXT的启动子，选择human，直接输入OXT，然后search  选择需要的，点击promoter ID  此时，出现了该基因的promoter 信息  接着需要寻找潜在的顺式作用元件了 在Analyze Sequence中，选择Matrix sequence, 然后go 在Sequence matrix to search for一栏中，option1选择 androgen，然后analyze http://bcs.keyan.cc/emuchnet/201 ... _1384763756_649.jpg 这样就找出了潜在的元件啦 剩下的就自己慢慢分析喽   1.jpg  2.jpg  3.jpg   1.jpg  1.jpg  6.jpg [ Last edited by silicare on 2014-2-18 at 08:53 ] |
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feilinshiji
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7楼2013-11-19 06:38:35
