应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » sorption模块关于力场、同位素、LJ势能等问题的求助
111/2返回列表12下一页
查看: 2141  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lusostty

金虫 (小有名气)

[求助] sorption模块关于力场、同位素、LJ势能等问题的求助

一个人孤单科研 问题一大堆 欢迎大家来讨论指教 谢谢
1.怎么把某个元素改成同位素？我在旁边isisotope已经改了 label标记也显示改了 但是计算结果显示的原子量为什么没变化呢？
2.应该怎么样把LJ势能参数用上去呢？在哪儿改？focite里的编辑力场？还是怎么弄？
3.应该是第二个的延伸 常在文献里看到 使用compass力场，又同时给出了LJ参数 计算的时候可以选两个？还是把两个力场合并了？

谢谢

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-11-04 20:34:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
问题1，我没研究过。
问题2，首先得明确COMPASS力场包含了你的物质，比如COMPASS对无机物覆盖有限；如果要自己拟合力场，得用GULP模块。
问题3，COMPASS力场已经包含LJ参数，如果COMPASS已经覆盖了该物质的话。
赞一下(1人) 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2013-11-04 21:44:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-11-06 09:48:42
isotope参照下面更改

sorption模块关于力场、同位素、LJ势能等问题的求助
赞一下(1人) 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2013-11-06 08:55:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

lusostty

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2013-11-04 21:44:37
问题1，我没研究过。
问题2，首先得明确COMPASS力场包含了你的物质，比如COMPASS对无机物覆盖有限；如果要自己拟合力场，得用GULP模块。
问题3，COMPASS力场已经包含LJ参数，如果COMPASS已经覆盖了该物质的话。

谢谢你的回复
假如我用compass力场去模拟MFI对CO2的吸附，并且得到结果 那我应该去哪儿找到LJ参数呢？

再者 如果计算机给出的LJ参数和我查阅的文献不一样呢 我该如何修改？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
3楼2013-11-05 08:34:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lusostty

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2013-11-06 08:55:45
isotope参照下面更改

嗯 谢谢  我也是这么修改的
但是用dmol优化后发现原子质量并木有改变
sorption模块关于力场、同位素、LJ势能等问题的求助-1
捕获.PNG
赞一下 回复此楼
5楼2013-11-06 09:33:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-11-22 14:34:14
确实在输出文件显示了C只有12
不知道是不是因为
STANDARD THERMODYNAMIC QUANTITIES
自动改成稳定的C12

输出文件夹里的模型还是C13的
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
6楼2013-11-06 10:00:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lusostty

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by pigrass at 2013-11-06 10:00:54
确实在输出文件显示了C只有12
不知道是不是因为
STANDARD THERMODYNAMIC QUANTITIES
自动改成稳定的C12

输出文件夹里的模型还是C13的

嗯 是的  所以我就搞不懂它到底改没改变
赞一下 回复此楼
7楼2013-11-06 14:26:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+5, 感谢耐心指导！ 2013-11-22 14:34:28
引用回帖:
7楼: Originally posted by lusostty at 2013-11-06 14:26:53
嗯 是的  所以我就搞不懂它到底改没改变...

我看了下，那段差不多在计算频率结果的位置，所以说计算频率的时候肯定改了。。。其他性质的时候就不知道了。。。

按理来说，input文件应该包含结构信息，但是没找到可以修改的地方。。。

help里也没有同位素和dmol的交叉信息。。。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

lusostty
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
8楼2013-11-06 16:32:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lusostty

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by pigrass at 2013-11-06 16:32:18
我看了下，那段差不多在计算频率结果的位置，所以说计算频率的时候肯定改了。。。其他性质的时候就不知道了。。。

按理来说，input文件应该包含结构信息，但是没找到可以修改的地方。。。

help里也没有同位素 ...

嗯 不管怎样 非常感谢 sorption力场那块你会么 能不能指导一下
赞一下 回复此楼
9楼2013-11-06 20:40:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ligesi

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2013-11-22 14:34:35
引用回帖:
9楼: Originally posted by lusostty at 2013-11-06 20:40:37
嗯 不管怎样 非常感谢 sorption力场那块你会么 能不能指导一下...

这个问题是这样的，sorption中有不同的原子表示，比如说，对于C原子而言，可以用C-1，C-2，C-3，C-34。。。，因此你可以打开立场文件Standard，用记事本打开Drinding或者其他力场。里面有很多不同的原子表示方式。。现在你只要选择晶包中的某内原子，在右下角Properties-ForceType改成相应的原子类型就可以
赞一下 回复此楼
新手驾到，O(∩_∩)O哈哈~
10楼2013-11-21 21:39:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lusostty 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 298求调剂 +5 上岸6666@ 2026-03-20 5/250 2026-03-22 15:46 by ColorlessPI
[考研] 生物学071000 329分求调剂 +4 我爱生物生物爱� 2026-03-17 4/200 2026-03-22 08:34 by hxsm
[考研] 333求调剂 +5 87639 2026-03-21 7/350 2026-03-21 19:31 by ColorlessPI
[考研] 材料学硕333求调剂 +3 北道巷 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:17 by 学员8dgXkO
[考研] 299求调剂 +4 某某某某位 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:30 by barlinike
[考研] 070300化学319求调剂 +7 锦鲤0909 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:46 by JourneyLucky
[考研] 085700资源与环境308求调剂 +12 墨墨漠 2026-03-18 13/650 2026-03-21 01:42 by JourneyLucky
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +9 Doleres 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:36 by JourneyLucky
[考研] 287求调剂 +7 晨昏线与星海 2026-03-19 8/400 2026-03-20 22:19 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 319求调剂 +3 小力气珂珂 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:47 by JourneyLucky
[考研] 08工学调剂 +5 用户573181 2026-03-20 5/250 2026-03-20 15:47 by xia_2003
[考研] 0856调剂，是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 085410人工智能专硕317求调剂（0854都可以） +4 xbxudjdn 2026-03-18 4/200 2026-03-20 09:07 by 不168
[考研] 081700化工学硕调剂 +3 【1】 2026-03-16 3/150 2026-03-19 23:40 by edmund7
[考研] 288求调剂，一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 312求调剂 +8 陌宸希 2026-03-16 9/450 2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭