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nininini1

新虫 (初入文坛)

[求助] 细胞信号通路,WB相关问题

我现在在做益生菌的胞外蛋白对MAPK和PI3K-AKT信号通路的影响,我想做如下内容,不知道可不可以,请大师们指点:第一部分,先用MTT法来做胞外蛋白对HT-29细胞的增殖抑制作用,(包括时间和浓度的依赖性);第二部分,分别检测两条通路的关键蛋白:MAPK中的JNK,ERK,p38蛋白(有一个问题:检测这三种蛋白还是检测磷酸化的这三种蛋白(即p-JNK,p-ERK,p-p38)? 有什么区别和意义吗?)PI3K-AKt的通路:我就检测PI3K和p-AKT这连个蛋白(查了很多文献都是检测这两种蛋白)。
求大神指点
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xiangyu9356

至尊木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


nininini1: 金币+1, ★★★★★最佳答案 2013-11-15 17:34:52
引用回帖:
10楼: Originally posted by nininini1 at 2013-11-14 20:56:52
不好意思,问错了不是一抗,二抗去除液,是用一抗孵育完,用TBST洗一下膜,这个tbst里面用加BSA或脱脂奶粉吗?...

洗一抗、二抗的时候,TBST不需要再加脱脂奶粉或者BSA。
满堂花醉三千客,更无一人是知音。
12楼2013-11-15 10:00:10
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xiangyu9356

至尊木虫 (小有名气)

引用回帖:
16楼: Originally posted by nininini1 at 2013-11-15 18:20:38
还想问一下:我最近想买抗体了,下面有几种抗体,不知道怎么选择,磷酸位点怎么选择,文献中Ser473的很多,

QQ截图20131115175839.png
...

应该选Ser473位点的。另外如果有条件最好选CST的XP版的,我们实验室一直在用CST 货号应该是4060.
另外对于贵师兄的western结果图,严格说来是不确切的,一般都是磷酸化形式与总的相比(比如应该是p-AKT/AKT),而不是磷酸化形式与内参的比值。
请慎重考虑,祝好!
满堂花醉三千客,更无一人是知音。
17楼2013-11-16 11:12:45
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
nininini1: 金币+1, ★★★很有帮助 2013-11-14 16:20:06
引用回帖:
3楼: Originally posted by nininini1 at 2013-11-05 20:24:24
我只检测磷酸化的这三种蛋白(即p-JNK,p-ERK,p-p38)可以吗?

当然不行。蛋白质磷酸化与蛋白质相互作用不是一回事。你的实验就是蛋白质-蛋白质相互作用,不用WB同样可以。红外、紫外、CD、NMR、核磁共振、免疫共沉淀、酵母双杂交等试验方法很多。
5楼2013-11-06 11:45:20
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xiangyu9356

至尊木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


nininini1: 金币+1, ★★★很有帮助 2013-11-14 13:03:25
引用回帖:
6楼: Originally posted by nininini1 at 2013-11-12 12:54:51
谢谢你的回复,我还想问一下,我用提取磷酸化蛋白试剂盒提取全蛋白,提取的蛋白可以做全蛋白的WB吗?(例如我用磷酸化蛋白试剂盒提取全蛋白用WB方法测p-p38的表达情况,还可以用这样提取的蛋白测p38蛋白的表达吗? ...

可以。提取磷酸化蛋白试剂盒是在提取过程中对磷酸化的蛋白有特殊保护,对总蛋白影响不大。
满堂花醉三千客,更无一人是知音。
7楼2013-11-13 09:28:35
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nininini1

新虫 (初入文坛)

自己顶一下
2楼2013-11-04 19:17:22
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nininini1

新虫 (初入文坛)

我只检测磷酸化的这三种蛋白(即p-JNK,p-ERK,p-p38)可以吗?
3楼2013-11-05 20:24:24
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xiangyu9356

至尊木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nininini1: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-11-12 12:55:12
引用回帖:
2楼: Originally posted by nininini1 at 2013-11-04 19:17:22
自己顶一下

一般都是要检测的。严格说来,这几种蛋白(包括AKT)都是磷酸化后才能反映其活性变化,所以最后是磷酸化形式与Total的比值来做统计的。
满堂花醉三千客,更无一人是知音。
4楼2013-11-06 10:41:46
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nininini1

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xiangyu9356 at 2013-11-06 10:41:46
一般都是要检测的。严格说来,这几种蛋白(包括AKT)都是磷酸化后才能反映其活性变化,所以最后是磷酸化形式与Total的比值来做统计的。...

谢谢你的回复,我还想问一下,我用提取磷酸化蛋白试剂盒提取全蛋白,提取的蛋白可以做全蛋白的WB吗?(例如我用磷酸化蛋白试剂盒提取全蛋白用WB方法测p-p38的表达情况,还可以用这样提取的蛋白测p38蛋白的表达吗?)
6楼2013-11-12 12:54:51
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nininini1

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by xiangyu9356 at 2013-11-13 09:28:35
可以。提取磷酸化蛋白试剂盒是在提取过程中对磷酸化的蛋白有特殊保护,对总蛋白影响不大。...

还想请教一个问题,我做磷酸化蛋白的Wb时,一抗,二抗用什么稀释(是用TBST稀释,TBST中要加BSA或者脱脂奶粉吗?)一抗,二抗的去除液是用TBST吗,里面用加BSA或者脱脂奶粉吗?
8楼2013-11-14 16:14:46
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nininini1

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-11-06 11:45:20
当然不行。蛋白质磷酸化与蛋白质相互作用不是一回事。你的实验就是蛋白质-蛋白质相互作用,不用WB同样可以。红外、紫外、CD、NMR、核磁共振、免疫共沉淀、酵母双杂交等试验方法很多。...

我们老师要用WB做,蛋白质-蛋白质相互作用,没明白什么意思?能具体讲讲吗?如果我的实验物质对细胞有效果,蛋白表达有正常的差异性,能说明的是什么问题? 谢谢您
9楼2013-11-14 16:19:52
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nininini1

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by nininini1 at 2013-11-14 16:14:46
还想请教一个问题,我做磷酸化蛋白的Wb时,一抗,二抗用什么稀释(是用TBST稀释,TBST中要加BSA或者脱脂奶粉吗?)一抗,二抗的去除液是用TBST吗,里面用加BSA或者脱脂奶粉吗?...

不好意思,问错了不是一抗,二抗去除液,是用一抗孵育完,用TBST洗一下膜,这个tbst里面用加BSA或脱脂奶粉吗?
10楼2013-11-14 20:56:52
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