[交流] [求助]auto dock的安装与使用

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1楼2007-12-11 20:43:54

回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

airconditioner

金虫 (正式写手)

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请问

请问你说的这个是windows界面安装吗，谢谢

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4楼2007-12-12 09:26:55

普通回帖

yelverxm

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我今天也在装，这是我老师给我的说明：
WINDOWS INSTALLATION:

1 - Install Python 2.0.1.
If you have this version of Python installed skip this step.

Download the Python-2.0.1.exe file to your desktop and double click on it.
Follow the installation instruction. We will assume that the interpreter has been installed in the default directory C:\PYTHON20.

2 - Extract the .zip files in C:\PYTHON20.
You should now have the Pmv, DejaVu, AutoDockTools ... directories in C:\PYTHON20. If instead you have a pack2.0_win32_acad directory containing Pmv, DejaVu, AutoDockTools etc.. you need to move the entire content of the pack2.0_win32_acad in C:\PYTHON20 in order for your installation to work.

3- Copy the C:\Python20\extra\glut32.dll in either C:\WINDOWS\SYSTEM32 or C:\WINNT\SYSTEM32.

4 - Start pmv, adt or viper by double clicking on the either the runPmv.pyw, runAdt.pyw or runViper.pyw icons located in the C:\PYTHON20.
NOTE: If several python interpreters are installed on the same machine make sure that the file is "Open With" python2.0.1.

Please go to our Frequently Asked Questions page (http://www.scripps.edu/~sanner/python/FAQ.html) if you have any installation problem. If your problem is not listed send an email to Sophie Coon (sophiec@scripps.edu)
Thanks for downloading our tools.

我也还没装上，多讨论呀，呵呵

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In God we trust

2楼2007-12-12 01:21:49

xufund

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我也试试。多谢！以后多交流！

3楼2007-12-12 07:09:36

luai071

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autodock 是linux下的程序，安装只要按照“Readme”做就可以了；如果想在window下装，可以先下载一个虚拟机，这样就可以模拟linux界面了。

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5楼2007-12-12 13:14:40

小淫虫808

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真那么简单？i 不信/。。。。

6楼2007-12-12 16:37:15

yelverxm

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引用回帖:

Originally posted by luai071 at 2007-12-12 13:14:
autodock 是linux下的程序，安装只要按照“Readme”做就可以了；如果想在window下装，可以先下载一个虚拟机，这样就可以模拟linux界面了。

autodock有windows的吧，我昨天都按照那个说明装上了，但是还没用哦。

蛋白还得先同源建模，然后再做对接

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7楼2007-12-13 12:02:01

luai071

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引用回帖:

蛋白还得先同源建模，然后再做对接

是啊不管是X衍射测出来的，还是同源模建，反正得有蛋白质的模型

8楼2007-12-13 14:19:57

xufund

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auto dock对硬件有哪些要求?硬盘空间多大?内存和显卡呢?

9楼2007-12-13 21:09:52

wjmed

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zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与，欢迎您常来计算模拟版解答问题。

AutoDock最新版本是4.0，运算速度慢了很多，如果可以，我建议你最好通过linux进行运算。另外，ADT是需要安装的，这样可以使用其中的python脚本进行输入文件的准备。而且，autodock3中的很多命令在autodock4中已经不能用，这是因为两个版本中输入文件（主要是受体和配体）格式有所不同。

我在论坛中有个帖子是总结这个软件的使用方法：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=644156

[ Last edited by wjmed on 2007-12-14 at 11:15 ]

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Timeandtidewaitsfornoman!

10楼2007-12-14 08:42:38