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monsoncupid

金虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by 珍维永久 at 2013-10-31 14:48:20
不是ligands未加氢,如果我不处理这一步,我在定义蛋白的时候就会弹出该警示框,那我直接定义sphere不用管这个就可以是吗?...

你monitor的结果是啥,发现缺键的原子是啥了么?你可以手动补上啊
宅若久时天然呆,呆到深处自然萌
11楼2013-10-31 19:07:57
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珍维永久

金虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by monsoncupid at 2013-10-31 19:07:57
你monitor的结果是啥,发现缺键的原子是啥了么?你可以手动补上啊...

monitor的结果是蛋白上的分子少原子,如果手动的话太多了,所以不知道该怎么进行了。
12楼2013-11-01 13:43:16
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monsoncupid

金虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by 珍维永久 at 2013-11-01 13:43:16
monitor的结果是蛋白上的分子少原子,如果手动的话太多了,所以不知道该怎么进行了。...

缺的那么多啊?你蛋白忘记加氢了吧,再不就是你PDB文件本身有问题,你clean protein 过么?
宅若久时天然呆,呆到深处自然萌
13楼2013-11-01 16:59:55
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putaosong

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by monsoncupid at 2013-10-25 20:16:02
这个是截图,设置好之后再clean protein就行了

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为什么我也是这样做的,可是结果还是一样,求帮忙……
我不生气,不代表我不伤心,我不哭,不代表我不心痛……
14楼2014-08-25 17:03:43
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wenhui1024

铜虫 (正式写手)

我也遇到同样的问题,但之前我也按照clean protein步骤处理过。
15楼2018-05-24 10:39:51
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kenryuwin

金虫 (著名写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by putaosong at 2014-08-25 17:03:43
为什么我也是这样做的,可是结果还是一样,求帮忙……...

想请教一下,clean protein 如何运行啊,设置完感谢apply后 好像不起作用,谢谢回复!
16楼2018-05-31 10:49:32
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