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drs1998

铜虫 (初入文坛)

[交流] GO分析和KEGG pathway分析 已有11人参与

本人想急需GO分析 和KEGG pathway分析，有哪位高人能教会，我愿以人民币的方式感谢，实在是着急，没办法了，高人请联系malon2000@126.com
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1楼 2013-10-25 10:48:09
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

libranjie

木虫 (小有名气)
★
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blastp

http://www.genome.jp/kegg/tool/map_pathway2.html
如果你输入了合适的可以识别的ID，例如KO编号，加颜色，将基因组的基因对应的KO编号输入KEGG就会得到图片，
其中存在的呈色彩，不通、不存在的用黑色表示。
要看菌株的，先进行比对，然后得到KO编号，在pathway里面有空白图片，mapxxxxx.conf里面有对应的位置，color上就可以了。
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13楼2013-12-26 17:10:24
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普通回帖

happy361

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
找个生物公司，直接付钱，还不担心数据被盗。
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2楼2013-10-25 21:04:47
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asr

荣誉版主 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你想知道哪方面呢？  找些书看看，免费就可以搞定了
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思想极度邪恶，勿怕勿怪！\(^o^)/~
3楼2013-10-27 19:41:39
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flooding

铜虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
找些书看看，总可以得到些结果，但视研究内容，不一定能得到需要的结果
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4楼2013-10-28 06:45:57
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青草娃娃

银虫 (初入文坛)
★
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你找到方法了吗？我也想做pathway的分析，可以向你请教一下吗？
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期待春雨
5楼2013-11-11 20:40:27
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drs1998

铜虫 (初入文坛)
内容已删除
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6楼2013-11-24 11:05:41
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asr

荣誉版主 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by drs1998 at 2013-11-24 11:05:41
您好！我想针对30个目的基因进行GO功能分类和亚细胞分类分析，我按照您说的找了些资料看看，但是只会在GO网站上对单个基因进行GO分析，可是不知道如何进行多个基因的分析，您能帮帮忙吗？我是真的特别着急，如果您 ...

你做的什么物种？已经有参考基因组了吧？
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思想极度邪恶，勿怕勿怪！\(^o^)/~
7楼2013-11-25 10:23:44
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yaoyl0679

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
顶一下，现在有没有这方面的书记可以学的？请牛人出来指点一下
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8楼2013-11-25 12:02:57
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drs1998

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by asr at 2013-11-25 10:23:44
你做的什么物种？已经有参考基因组了吧？...

人源
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9楼2013-11-26 09:31:19
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drs1998

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by drs1998 at 2013-11-26 09:31:19
人源...

我做了蛋白质差异分析，从里面找到了30个表达差异的蛋白，想对这30个表达差异的蛋白再进一步分析，比如亚细胞定位、信号通路分析等等，现在感觉我从下手，找书看都不知道从哪里找，请多多帮忙
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10楼2013-11-26 09:34:17
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