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benedictchau

铜虫 (小有名气)

[交流] 关于发酵液中蛋白提取 已有2人参与

大牛们,小弟研一 刚做了一株菌,老板想让我分析一下它的抑菌物质具体成分,
跑过活性电泳 有带但是回收后感觉没有抑菌活性了- -
大家还有什么好的建议么?
我想先看看这个到底是不是蛋白质
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
laozuzunzhe: MicEPI+1, 鼓励热心应助! 2013-10-30 21:17:14
引用回帖:
9楼: Originally posted by benedictchau at 2013-10-30 08:27:49
我想问一下3K的滤膜 超滤之后得到的滤液 一部分沸水浴 10min 另一部分保持原样牛津杯法测量  若煮沸的没有抑菌圈 能说明抑菌物质是蛋白质么  3K与蛋白质分子量单位如何转化啊? 跪谢...

可以是可以,但是你的这个物质最好是能定量,确切知道进行了某一个处理之后能够保留多少。牛津杯法不知道能不能精确定量,这个方法挺麻烦的。

处理方法不宜一下子就进行两个,比如超滤和煮沸这两个,如果之前都不知道每一个方法的效果,结合起来就更加说不清了。哪一步处理之后有多纯,回收多少,最怕就是糊里糊涂的做,做完之后也还是糊里糊涂。

为什么要一开始就确定是不是蛋白质?假如是几个氨基酸残基的寡肽,没有二级结构的,即使是煮沸也不会灭活的。而即使是蛋白质,也不一定就不能耐受萃取中的有机溶剂,就像是某些酶能耐受高浓度有机溶剂,例如:
Biochemical characterization of an extracellular polyextremophilic alpha-amylase from the halophilic archaeon Halorubrum xinjiangense有机溶剂.pdf
Effect of non aqueous solvent on structural stability of alpha-amylase A cost-effective prospective for protein stabilization有机溶剂.pdf
2012年 有机溶剂 IF(2011)=1.683 Purification and characterization of an organic solvent-tolerant alkaline cellulase from a halophilic isolate of Thalassobacillus.pdf
2012年 有机溶剂 IF(2011)=2.735 Purification and characterization of an organic-solvent-tolerant cellulase from a halotolerant isolate, Bacillus sp. L1.pdf

最好就是设计一些方案来分离,按照分离效果来一步步减少杂质,最终得到纯品,这下子再鉴定就完全明白了,在此之前的都只能是猜测。别偷懒,在等待的时间里可以同时尝试,不要等菌长的时候就去看PPS。

你的这句“跑过活性电泳 有带但是回收后感觉没有抑菌活性了”是什么意思?“活性电泳”、“有带”、“回收”、“感觉”这四个词,我猜你的这个实验出了问题了,设计上或者操作上。活性电泳和非变性电泳是不同的,非变性电泳是保持非变性,但活性电泳不一定要保持非变性,只要能复性就行,而且要体现出活性。我猜你是跑了非变性电泳然后把蛋白质条带割下来回收了。这么做有一个前提,那就是这个物质肯定是蛋白质,而且能跑胶跑得出来,但其实这个物质还不一定是蛋白质。“感觉”这个词令我怀疑有没有准确定量。不管怎么说,还是把自己的实验步骤操作试剂分析放上来的好。

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  • 附件 1 : CMC酶细菌文献.rar
  • 2013-10-30 19:09:03, 1.68 M
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
11楼2013-10-30 19:17:08
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benedictchau

铜虫 (小有名气)

大家帮我看下吧,谢谢你们啊!!!
2楼2013-10-25 11:16:01
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
那你就设计一些实验来对成分进行分离,看看哪些组分里有活性,也不一定是蛋白质的。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
4楼2013-10-27 00:44:37
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benedictchau

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2013-10-27 00:44:37
那你就设计一些实验来对成分进行分离,看看哪些组分里有活性,也不一定是蛋白质的。

现在就是没数到底设计啥实验的- -唉,条件艰苦- -
5楼2013-10-28 21:14:16
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