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三木713

新虫 (小有名气)

[求助] 有没有研究淀粉方面分子动力学的大牛啊、本人菜鸟太多问题、需要帮助啊!!!

有没有人研究淀粉、或是碳水化合物方面的、其他的也行、只要是比较熟悉gromacs的同学、希望能找几个人帮助我、、本人是学食品的、跟计算机材料什么的本来就不怎么了解、可是要做分子动力学、所以希望能找人教我指导我。已经自己学习了3个月了、研究学习别人案例了很久、现在开始做自己的课题、一上来就是问题、很苦恼。。。。。
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vatano

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
三木713: 金币+2, 有帮助 2013-10-26 09:37:26
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2013-10-29 14:34:19
淀粉、碳水化合物、纤维素、木质素等的分子动力学研究还是挺多人做的,这是一个大方向,文献也挺多。我曾经用CHARMM做过这方面的计算。CHARMM里头目前这方面的力场参数也都有了。GROMACS的应该也有。在产生单链多聚物后,再根据具体要求是有序重叠还是随机的,就可以模拟了。
我看你的问题不在于是否是淀粉体系,其实还是先了解掌握分子动力学模拟吧
2楼2013-10-25 09:55:17
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阿德

金虫 (正式写手)

你是做淀粉的?

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2013-10-25 16:37:20
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三木713

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by vatano at 2013-10-25 09:55:17
淀粉、碳水化合物、纤维素、木质素等的分子动力学研究还是挺多人做的,这是一个大方向,文献也挺多。我曾经用CHARMM做过这方面的计算。CHARMM里头目前这方面的力场参数也都有了。GROMACS的应该也有。在产生单链多聚 ...

我要做的是淀粉老化机理方面、要是要我用gromacs做、可我们实验室是纯做食品的、没人做过分子动力学方面的、周围也没人做过、是应该掌握分子模拟、关键是自己需要个人指导一下、一模拟就出错、很苦恼
4楼2013-10-26 09:33:36
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三木713

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 阿德 at 2013-10-25 16:37:20
你是做淀粉的?

我现在做的是直链淀粉老化机理的研究、你也是?
5楼2013-10-26 09:36:46
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阿德

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 三木713 at 2013-10-26 09:36:46
我现在做的是直链淀粉老化机理的研究、你也是?...

我做淀粉结构的,你是哪个院校的
6楼2013-10-26 20:21:20
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三木713

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 阿德 at 2013-10-26 20:21:20
我做淀粉结构的,你是哪个院校的...

南昌大学的、你也是用分子动力学做淀粉结构么?
7楼2013-10-28 08:34:14
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阿德

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 三木713 at 2013-10-28 08:34:14
南昌大学的、你也是用分子动力学做淀粉结构么?...

嗯,你做的什么淀粉?
8楼2013-10-28 09:55:48
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wu3833145

木虫 (正式写手)

食品领域也可以搞计算化学啊
我孤陋寡闻了;
9楼2013-10-28 15:42:10
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三木713

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 阿德 at 2013-10-28 09:55:48
嗯,你做的什么淀粉?...

我现在做最简单的直链淀粉、可是画结构出pdb格式到gromacs里总说残基找不到、你会用gaussview或是materials studio画么?50个单元的就可以了、、求助啊
10楼2013-10-29 08:48:36
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