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梦境先生

金虫 (小有名气)

[求助] MTT对照组的OD值比加药组低,怎么回事?

1.我现在在做药物浓度梯度,这些药都是经过初筛的,都有比较好的细胞毒性。但是,我的结果中总有那么几个药的值高于对照组的OD值,搞得整个数据不可信。我的对照组就是不加药,只加稀释后的DMSO,细胞悬液的孔,不是调零孔。
2.和老师了讨论下,他认为是我对照孔中DMSO稀释浓度的问题,可我每孔200ul的细胞悬液中DMSO比重是千分之一的啊,不至于对细胞产生毒性啊,把OD值搞得低了一些。
3.对照组比加药组OD值低是个别几个药,而且就低0.1~0.15.
4.最后,请问排版能解决问题吗?就是把DMSO孔加到中间点的位置,而不是边缘
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忙我所欲也,闲亦我所欲也
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浪滴

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
梦境先生: 金币+5, 有帮助 2013-10-22 22:46:29
laozuzunzhe: 金币+3, 鼓励热心应助! 2013-10-23 09:07:09
1 请问你重复了几次?
2 大部分情况下对照组的OD值比给药组低很正常,这是为什么细胞毒活性实验重复率不高的原因
3  建议多重复几次
4 96孔板排除边缘的那一列,也就60个孔能用
5 建议你和经常做细胞毒实验的同学交流下
   我也仅仅做了一年的细胞毒实验,也经常出现你所描述的情况,没办法,只有重复,向别人情况!
   加油!
2楼2013-10-22 21:27:16
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梦境先生

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 浪滴 at 2013-10-22 21:27:16
1 请问你重复了几次?
2 大部分情况下对照组的OD值比给药组低很正常,这是为什么细胞毒活性实验重复率不高的原因
3  建议多重复几次
4 96孔板排除边缘的那一列,也就60个孔能用
5 建议你和经常做细胞毒实验的同 ...

我做了MCF 7,231,A5493种细胞各一次。因为是筛选出来的,按理来说,不会有负值,就是对照组OD比给药组低的情况。这个细胞毒实验重复率不高也有耳闻,初筛的时候,我就发现活性不好的药物各种负值
忙我所欲也,闲亦我所欲也
3楼2013-10-22 22:50:31
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梦境先生

金虫 (小有名气)

还有木有大神回复?自己顶一个
忙我所欲也,闲亦我所欲也
4楼2013-10-23 22:38:42
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daibingling

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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梦境先生: 金币+5, 有帮助 2013-10-24 20:15:54
1,96孔板边缘的孔是不能用,仔细观察,每次培养后,这些孔中的培养基液面会低于中间孔,应该是液体蒸发的原因。
2,对照组孔数值低于给药组,这种现象是经常发生,原因不一定是药物的原因,比如接种细胞的不均匀,试剂加入的量不均匀,这种情况就多做几个复孔,然后多重复几次,删除异常数据,然后取平均值。
3,DMSO含量千分之一对细胞基本没毒性,我做过至少二十种细胞,这个没问题的。
细胞毒性实验就是挺折磨人的,我四年做了N块板,哈哈
5楼2013-10-24 09:57:24
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梦境先生

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by daibingling at 2013-10-24 09:57:24
1,96孔板边缘的孔是不能用,仔细观察,每次培养后,这些孔中的培养基液面会低于中间孔,应该是液体蒸发的原因。
2,对照组孔数值低于给药组,这种现象是经常发生,原因不一定是药物的原因,比如接种细胞的不均匀, ...

1.感觉接种均匀真心难,边加边摇离心管或者加几个孔就吹打一次感觉都差不多,说不清哪个方法接种细胞更均匀
2.看来我只好把对照组的孔多铺几个,取较大的值
3.挺折磨人的
忙我所欲也,闲亦我所欲也
6楼2013-10-24 20:19:37
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