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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 质谱分析 » 关于做代谢组学，希望前辈们提提意见
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wyxiaofan3

新虫 (小有名气)

[求助] 关于做代谢组学，希望前辈们提提意见 已有2人参与

本人刚接触代谢组学，想请教做代谢组学的前辈们，用Q-TOF做时数据可以导出成CVS格式，然后进行后续处理，那如果用GC-MS做的话，能不能导出数据啊？现在正在徘徊着用哪种仪器做比较好，比较快？先谢谢前辈们提意见了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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1楼 2013-10-18 13:14:47
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wyy080214

实习版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
费姚永芬: 金币+3, 辛苦啦！ 2013-10-19 08:05:55
要说好的话，首选Q-TOP，高分辨率质谱，但是价格稍高，对操作人员要求也较高，GC-MS可以导出数据，离线解谱都可以，但是分辨率和TOF不在一个档次，要快的话，只要设计合理，用什么仪器都快，工具而已。
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2楼2013-10-18 14:49:20
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wyxiaofan3

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wyy080214 at 2013-10-18 14:49:20
要说好的话，首选Q-TOP，高分辨率质谱，但是价格稍高，对操作人员要求也较高，GC-MS可以导出数据，离线解谱都可以，但是分辨率和TOF不在一个档次，要快的话，只要设计合理，用什么仪器都快，工具而已。

谢谢你的回答，那用GC-MS做代谢组学时，导出的数据格式是哪种啊？包括分子量，保留时间，峰面积吗？是不是用GC-MS比Q-TOF在定性方面快些啊？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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3楼2013-10-19 22:26:02
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wyy080214

实习版主 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wyxiaofan3 at 2013-10-19 22:26:02
谢谢你的回答，那用GC-MS做代谢组学时，导出的数据格式是哪种啊？包括分子量，保留时间，峰面积吗？是不是用GC-MS比Q-TOF在定性方面快些啊？
...

格式我记不清楚了，至于分子量，保留时间，峰面积都有，说起定性，个人觉得Q-TOF是定性之神，分子量小数点后4-7位，高分辨质谱啊。。
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4楼2013-10-19 23:31:15
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萧邦boy

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

平台的选择要结合你的研究目的，做靶标就选UPLC-QTOF-MS，跑标品准确定性。但如果想检测样品的所有代谢物，然后寻找组间差异的，建议LECO高端全二维气相色谱-飞行时间质谱联用仪（GC*GC-TOF-MS），图谱采集速率达到500全扫描图谱/秒，保真解卷积和自动峰识别技术，免维护离子源，超强稳定性以及超高灵敏度。原始数据导出smp格式可转化cdf格式后做compare，包括分子量，保留时间，峰面积，相似度。。。
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5楼2013-12-17 14:39:09
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metabolomics

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 萧邦boy at 2013-12-17 14:39:09
平台的选择要结合你的研究目的，做靶标就选UPLC-QTOF-MS，跑标品准确定性。但如果想检测样品的所有代谢物，然后寻找组间差异的，建议LECO高端全二维气相色谱-飞行时间质谱联用仪（GC*GC-TOF-MS），图谱采集速率达到 ...

5楼是仪器控！说实话可能没有实际做过研究！
UPLC-QTOF-MS是做非靶标（筛选），而不是靶标。
LECO的这个仪器实际用下来与Agilent的GC/MS没多大差异，但是维护成本高和操作复杂显得不实用，且数据量太庞大，对数据处理要求太高，往往得不偿失！LECO这个仪器用于小样本倒是不错的。但是要清楚，这个TOF只是采集速率高，并不是高分辨。
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6楼2014-03-08 21:55:14
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cpn

木虫 (正式写手)
特地来支持一下6楼，特别支持最后一句话~采集速率高，对做代谢很有优势的。
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7楼2014-04-17 11:18:08
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3306245

金虫 (初入文坛)

赶路人
引用回帖:
6楼: Originally posted by metabolomics at 2014-03-08 21:55:14
5楼是仪器控！说实话可能没有实际做过研究！
UPLC-QTOF-MS是做非靶标（筛选），而不是靶标。
LECO的这个仪器实际用下来与Agilent的GC/MS没多大差异，但是维护成本高和操作复杂显得不实用，且数据量太庞大，对数据 ...

请教一下，一个代谢组学样品的测定大约需要多少钱？谢谢
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万物守恒！
8楼2015-01-09 08:51:37
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