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wyxiaofan3

新虫 (小有名气)

[求助] 关于做代谢组学,希望前辈们提提意见 已有2人参与

本人刚接触代谢组学,想请教做代谢组学的前辈们,用Q-TOF做时数据可以导出成CVS格式,然后进行后续处理,那如果用GC-MS做的话,能不能导出数据啊?现在正在徘徊着用哪种仪器做比较好,比较快?先谢谢前辈们提意见了

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wyy080214

实习版主 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wyxiaofan3 at 2013-10-19 22:26:02
谢谢你的回答,那用GC-MS做代谢组学时,导出的数据格式是哪种啊?包括分子量,保留时间,峰面积吗?是不是用GC-MS比Q-TOF在定性方面快些啊?
...

格式我记不清楚了,至于分子量,保留时间,峰面积都有,说起定性,个人觉得Q-TOF是定性之神,分子量小数点后4-7位,高分辨质谱啊。。
4楼2013-10-19 23:31:15
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wyy080214

实习版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
费姚永芬: 金币+3, 辛苦啦! 2013-10-19 08:05:55
要说好的话,首选Q-TOP,高分辨率质谱,但是价格稍高,对操作人员要求也较高,GC-MS可以导出数据,离线解谱都可以,但是分辨率和TOF不在一个档次,要快的话,只要设计合理,用什么仪器都快,工具而已。
2楼2013-10-18 14:49:20
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wyxiaofan3

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wyy080214 at 2013-10-18 14:49:20
要说好的话,首选Q-TOP,高分辨率质谱,但是价格稍高,对操作人员要求也较高,GC-MS可以导出数据,离线解谱都可以,但是分辨率和TOF不在一个档次,要快的话,只要设计合理,用什么仪器都快,工具而已。

谢谢你的回答,那用GC-MS做代谢组学时,导出的数据格式是哪种啊?包括分子量,保留时间,峰面积吗?是不是用GC-MS比Q-TOF在定性方面快些啊?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2013-10-19 22:26:02
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萧邦boy

新虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

平台的选择要结合你的研究目的,做靶标就选UPLC-QTOF-MS,跑标品准确定性。但如果想检测样品的所有代谢物,然后寻找组间差异的,建议LECO高端全二维气相色谱-飞行时间质谱联用仪(GC*GC-TOF-MS),图谱采集速率达到500全扫描图谱/秒,保真解卷积和自动峰识别技术,免维护离子源,超强稳定性以及超高灵敏度。原始数据导出smp格式可转化cdf格式后做compare,包括分子量,保留时间,峰面积,相似度。。。
5楼2013-12-17 14:39:09
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