24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2436  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

625915317

金虫 (初入文坛)

[求助] AutoDock大分子问题

新手求助:从蛋白质数据库里下载的大分子是不是不能直接用到AutoDock中做分子对接?要做哪些处理?怎么做?详细点,谢谢大家帮忙
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sjputao

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
625915317: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-10-25 16:58:44
你说的大分子指的是蛋白质吧,可以用pymol软件处理,删除水分子,一些金属离子和配体,基本上就可以了
12楼2013-10-24 10:56:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

紫漠残星

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
625915317: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-10-25 16:56:41
你在论坛里搜索下,会有很多ADT的教程的

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : [emuch.net]AutoDock_ADT教程_AutoDockTools_分子对接_中文.pdf
  • 2013-10-18 10:52:53, 6.15 M
努力,不放弃
2楼2013-10-18 10:53:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuyao0513

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
应该可以的,好像还需要模板的!!具体还得问问高手怎么操作~~
3楼2013-10-18 12:21:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

药物设计

捐助贵宾 (小有名气)

BioMS.org


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
625915317: 金币+1, 有帮助 2013-10-25 16:56:55
赋予AD原子类型,加氢、加电荷,合并非极性氢。

当然,如果有水分子,磷酸等杂分子,你又不需要,还需要去掉。
4楼2013-10-18 15:44:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 计算机22408 281分,求调剂 +7 17715607211 2026-04-06 7/350 2026-04-12 00:43 by xuxiang
[考研] 286求调剂 +25 Faune 2026-04-06 25/1250 2026-04-11 23:23 by labixiaoqiao
[考研] 296求调剂 +6 汪!?! 2026-04-09 6/300 2026-04-11 11:25 by zhq0425
[考研] 化工求调剂! +35 RichLi_ 2026-04-06 35/1750 2026-04-11 11:02 by zhq0425
[考研] 295分求调剂 +9 ?要上岸? 2026-04-10 9/450 2026-04-11 10:48 by qingpingzhu
[考研] 296求调剂 +13 汪!?! 2026-04-10 15/750 2026-04-11 10:31 by 逆水乘风
[考研] 283求调剂,工科! +12 苏打水7777 2026-04-08 12/600 2026-04-11 10:28 by 逆水乘风
[考研] 284求调剂 +12 archer.. 2026-04-10 13/650 2026-04-11 08:44 by zhq0425
[考研] 298求调剂 +13 钉叮咚冬瓜 2026-04-09 13/650 2026-04-10 15:49 by jiajinhpu
[考研] 一志愿双非085400电子信息344 求调剂,对材料和化学方向也感兴趣 +8 无情的小羊 2026-04-09 9/450 2026-04-10 09:30 by 松花缸1201
[考研] 生物与医药调剂 +5 十七sa 2026-04-05 5/250 2026-04-10 08:14 by kangsm
[考研] 284求调剂 +7 让我上岸吧阿西 2026-04-09 7/350 2026-04-09 18:59 by haironglove
[考研] 367求调剂 +10 hffQAQ 2026-04-09 10/500 2026-04-09 18:06 by lijunpoly
[考研] 332,085601求调剂 +12 ydfyh 2026-04-09 14/700 2026-04-09 17:28 by wp06
[考研] 材料工程调剂 +12 小刘同学吖吖 2026-04-06 13/650 2026-04-09 17:07 by luoyongfeng
[考研] 085801 总分275 本科新能源 求调剂 +8 bradoner 2026-04-08 9/450 2026-04-09 13:43 by only周
[考研] 298求调剂 +4 manman511 2026-04-05 4/200 2026-04-08 16:50 by tjzhao
[考研] 一志愿南京航空航天大学 材料与化工329分求调剂 +11 Mr. Z 2026-04-05 12/600 2026-04-08 16:15 by luoyongfeng
[考研] 332求调剂 +17 小小孟... 2026-04-05 18/900 2026-04-06 09:51 by 蓝云思雨
[考研] 08专硕275调剂 +5 AaAa7420 2026-04-05 5/250 2026-04-05 18:01 by jkddd
信息提示
请填处理意见