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sybyl7.3的问题
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大家好，我想请教一下，在网上下载的sybyl7.3中的QSAR模块好用吗？我用molconn-z时候，根据manual上的步骤，刚刚做到gzip -cd $TA_DEMO/molconn_z/molconn_z.tar.gz | tar xvf - 这一步，执行这个命令，确实解压了，但是In the Read File dialog, select cocaine.mol2. 取小分子的时候，却提示没有发现cocaine.mol2 ，这是 怎么回事啊？ 还有，这个 sh命令是什么意思啊，是跳到sybyl所在的目录吗？molconn-z.tar.gz在那个目录啊？解压之后又是在哪？ 还有，哪位战友，按照manual，把QSAR模块做完了，是不是可以完全按照manual做啊？ 想做comfa，按照manual能够完全走下去吗？ 真心希望，有经验的战友们，给我个帮助，在这先谢了！ |
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4楼2008-03-03 08:16:16
2楼2007-12-04 21:00:05
alwens
铁杆木虫 (正式写手)
老木虫
- 应助: 0 (幼儿园)
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- 专业: 药物设计与药物信息
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karl2100(金币+1,VIP+0):多谢指教！
karl2100(金币+1,VIP+0):多谢指教！
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来了：） 第一个问题我也不知道，哈哈 命令是解压文件：$TA_DEMO/molconn_z/molconn_z.tar.gz 解压后如果没错的话会在$TA_DEMO/molconn_z/molconn_z这个目录， 这里的$TA_DEMO是sybyl内部的环境变量 你在sybyl的提示符下键入命令：echo $TA_DEMO, 即： SYBYL> echo $TA_DEMO 可以打印出这个变量定义的绝对路径，比如在我的系统上给出的结果是： /usr/people/sybyl/sybyl7.3/demo/unix/ 那么你解压的这个压缩文件就是: /usr/people/sybyl/sybyl7.3/demo/unix/molconn_z/molconn_z.tar.gz 你可以在在sybyl环境外解压这个文件到任意目录，可以发现里面是有你要的cocaine.mol2分子的。 lz好运！ |
3楼2007-12-14 19:31:54
