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haoming_0027

[交流] sybyl7.3的问题

大家好,我想请教一下,在网上下载的sybyl7.3中的QSAR模块好用吗?我用molconn-z时候,根据manual上的步骤,刚刚做到gzip -cd $TA_DEMO/molconn_z/molconn_z.tar.gz | tar xvf -   这一步,执行这个命令,确实解压了,但是In the Read File dialog, select cocaine.mol2.   取小分子的时候,却提示没有发现cocaine.mol2 ,这是 怎么回事啊?
     还有,这个  sh命令是什么意思啊,是跳到sybyl所在的目录吗?molconn-z.tar.gz在那个目录啊?解压之后又是在哪?
    还有,哪位战友,按照manual,把QSAR模块做完了,是不是可以完全按照manual做啊?

     想做comfa,按照manual能够完全走下去吗?
   真心希望,有经验的战友们,给我个帮助,在这先谢了!
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cpucf

铁杆木虫 (知名作家)

相由心生,境随心转

PM   alwens斑竹!
相由心生,境随心转!存好心,说好话,行好事,做好人!
2楼2007-12-04 21:00:05
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alwens

铁杆木虫 (正式写手)

老木虫


karl2100(金币+1,VIP+0):多谢指教!
来了:)
第一个问题我也不知道,哈哈
命令是解压文件:$TA_DEMO/molconn_z/molconn_z.tar.gz
解压后如果没错的话会在$TA_DEMO/molconn_z/molconn_z这个目录,
这里的$TA_DEMO是sybyl内部的环境变量
你在sybyl的提示符下键入命令:echo $TA_DEMO, 即:
SYBYL> echo $TA_DEMO
可以打印出这个变量定义的绝对路径,比如在我的系统上给出的结果是:
/usr/people/sybyl/sybyl7.3/demo/unix/
那么你解压的这个压缩文件就是:
/usr/people/sybyl/sybyl7.3/demo/unix/molconn_z/molconn_z.tar.gz
你可以在在sybyl环境外解压这个文件到任意目录,可以发现里面是有你要的cocaine.mol2分子的。

lz好运!
万里夕阳锦背高 翻身犹恨东洋小 太公怎钓?
3楼2007-12-14 19:31:54
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haoming_0027

谢谢 答复, 问题已经解决
4楼2008-03-03 08:16:16
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