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sybyl7.3的问题
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大家好,我想请教一下,在网上下载的sybyl7.3中的QSAR模块好用吗?我用molconn-z时候,根据manual上的步骤,刚刚做到gzip -cd $TA_DEMO/molconn_z/molconn_z.tar.gz | tar xvf - 这一步,执行这个命令,确实解压了,但是In the Read File dialog, select cocaine.mol2. 取小分子的时候,却提示没有发现cocaine.mol2 ,这是 怎么回事啊? 还有,这个 sh命令是什么意思啊,是跳到sybyl所在的目录吗?molconn-z.tar.gz在那个目录啊?解压之后又是在哪? 还有,哪位战友,按照manual,把QSAR模块做完了,是不是可以完全按照manual做啊? 想做comfa,按照manual能够完全走下去吗? 真心希望,有经验的战友们,给我个帮助,在这先谢了! |
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2楼2007-12-04 21:00:05
alwens
铁杆木虫 (正式写手)
老木虫
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karl2100(金币+1,VIP+0):多谢指教!
karl2100(金币+1,VIP+0):多谢指教!
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来了:) 第一个问题我也不知道,哈哈 命令是解压文件:$TA_DEMO/molconn_z/molconn_z.tar.gz 解压后如果没错的话会在$TA_DEMO/molconn_z/molconn_z这个目录, 这里的$TA_DEMO是sybyl内部的环境变量 你在sybyl的提示符下键入命令:echo $TA_DEMO, 即: SYBYL> echo $TA_DEMO 可以打印出这个变量定义的绝对路径,比如在我的系统上给出的结果是: /usr/people/sybyl/sybyl7.3/demo/unix/ 那么你解压的这个压缩文件就是: /usr/people/sybyl/sybyl7.3/demo/unix/molconn_z/molconn_z.tar.gz 你可以在在sybyl环境外解压这个文件到任意目录,可以发现里面是有你要的cocaine.mol2分子的。 lz好运! |

3楼2007-12-14 19:31:54
4楼2008-03-03 08:16:16













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