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永远一片天

新虫 (正式写手)

[求助] 如何用NCBI或者Primer5.0设计引物?

如何设计流感嗜血杆菌的外膜蛋白p6的引物,一对引物可以用来检测所有流感嗜血杆菌的病原体。NCBI上查找到许多的p6,但是都是氨基酸序列,如何设计引物呢?求专业人士回答,急需!谢谢
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hezhao311

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
永远一片天: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-14 19:49:00
设计引物必须知道核酸序列,仅仅知道氨基酸序列还不行。能告诉NCBI的序列编号吗?
2楼2013-10-14 16:02:38
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永远一片天

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hezhao311 at 2013-10-14 16:02:38
设计引物必须知道核酸序列,仅仅知道氨基酸序列还不行。能告诉NCBI的序列编号吗?

谢谢,非常谢谢啊,但是我只知道流感嗜血杆菌haemophilus influenzae(HI)的外膜蛋白基因p6,其它的我查不出来,您在protein数据库输入p6  and haemophilus influenzae 就会出来好多,这个麻烦您了,抱歉。基本上出来的全都是氨基酸序列,可是怎么设计呢
3楼2013-10-14 19:48:22
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hezhao311

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

jssxh: 检索EPI+1, 谢谢你的支持! 2013-10-15 11:40:10
要到核酸Nucleotide库中查找,而不是蛋白库。如http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC332072.1 就是有关haemophilus influenzae(HI)的外膜蛋白基因p6的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-10-15 07:44:14
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永远一片天

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by hezhao311 at 2013-10-15 07:44:14
要到核酸Nucleotide库中查找,而不是蛋白库。如http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC332072.1 就是有关haemophilus influenzae(HI)的外膜蛋白基因p6的。

谢谢您!
5楼2013-10-15 13:37:42
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永远一片天

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by hezhao311 at 2013-10-15 07:44:14
要到核酸Nucleotide库中查找,而不是蛋白库。如http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC332072.1 就是有关haemophilus influenzae(HI)的外膜蛋白基因p6的。

老师,您好,能再帮我解答下吗?非常感谢!多重PCR检测,已经设计好了几对引物,但不知道引物间是否形成二聚体、放在同一反应体系的反应效果怎么样,怎么样进行引物间比对评价呢?
6楼2013-10-15 16:41:24
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