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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 文献求助区 » 检索知识 » 检索方法 » 如何用NCBI或者Primer5.0设计引物?
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永远一片天

新虫 (正式写手)

[求助] 如何用NCBI或者Primer5.0设计引物?

如何设计流感嗜血杆菌的外膜蛋白p6的引物，一对引物可以用来检测所有流感嗜血杆菌的病原体。NCBI上查找到许多的p6，但是都是氨基酸序列，如何设计引物呢？求专业人士回答，急需！谢谢
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1楼 2013-10-14 11:36:56
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hezhao311

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
永远一片天: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-14 19:49:00
设计引物必须知道核酸序列，仅仅知道氨基酸序列还不行。能告诉NCBI的序列编号吗？
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2楼2013-10-14 16:02:38
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永远一片天

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hezhao311 at 2013-10-14 16:02:38
设计引物必须知道核酸序列，仅仅知道氨基酸序列还不行。能告诉NCBI的序列编号吗？

谢谢，非常谢谢啊，但是我只知道流感嗜血杆菌haemophilus influenzae(HI)的外膜蛋白基因p6，其它的我查不出来，您在protein数据库输入p6  and haemophilus influenzae 就会出来好多，这个麻烦您了，抱歉。基本上出来的全都是氨基酸序列，可是怎么设计呢
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3楼2013-10-14 19:48:22
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hezhao311

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

jssxh: 检索EPI+1, 谢谢你的支持！ 2013-10-15 11:40:10
要到核酸Nucleotide库中查找，而不是蛋白库。如http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC332072.1 就是有关haemophilus influenzae(HI)的外膜蛋白基因p6的。
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永远一片天 永远一片天
4楼2013-10-15 07:44:14
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永远一片天

新虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by hezhao311 at 2013-10-15 07:44:14
要到核酸Nucleotide库中查找，而不是蛋白库。如http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC332072.1 就是有关haemophilus influenzae(HI)的外膜蛋白基因p6的。

谢谢您！
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5楼2013-10-15 13:37:42
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永远一片天

新虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by hezhao311 at 2013-10-15 07:44:14
要到核酸Nucleotide库中查找，而不是蛋白库。如http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC332072.1 就是有关haemophilus influenzae(HI)的外膜蛋白基因p6的。

老师，您好，能再帮我解答下吗？非常感谢！多重PCR检测，已经设计好了几对引物，但不知道引物间是否形成二聚体、放在同一反应体系的反应效果怎么样，怎么样进行引物间比对评价呢？
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6楼2013-10-15 16:41:24
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