24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3142  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 关于高斯PCM模型输入问题

我想要UFF力场来考虑溶剂的半径,输入文件如下:
#p b3lyp/6-311++G(d,p) scf=tight scrf=(pcm,read,solvent=acetone) opt freq
分子坐标....

radii=UFF

我想问下:1.这样的输入文件,高斯是不是读取UFF力场下的丙酮溶剂半径?
          2.同时,默认溶剂其他性质例如介电常数之类,仍然是丙酮的吧?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sujialing

木虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by cg陈 at 2013-11-07 08:52:02
你用的软件是03的吗?...

我用的G09
越努力,越幸运!
13楼2013-11-07 08:53:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cg陈: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-14 09:18:02
gmy1990: 金币+2 2013-10-14 15:13:51
UFF应是高斯默认的,最后那句加与不加结果应该一致。以下节选自说明书:

“指定分子空穴
程序默认用UFF 半径构造空穴,也就是在每个溶质原子周围放置一个球,其半径用因
子1.1 换算。”
3楼2013-10-14 08:49:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-14 08:49:33
UFF应是高斯默认的,最后那句加与不加结果应该一致。以下节选自说明书:

“指定分子空穴
程序默认用UFF 半径构造空穴,也就是在每个溶质原子周围放置一个球,其半径用因
子1.1 换算。”

你指的是09的吧?我的03,03貌似没有默认是UFF。
其实我想知道这个仅仅只是定义了分子空穴的半径,不影响溶剂的其他参数吧?我怕高斯会默认是水的参数。
4楼2013-10-14 09:20:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
cg陈: 金币+2, 有帮助 2013-10-14 09:52:25
引用回帖:
4楼: Originally posted by cg陈 at 2013-10-14 09:20:32
你指的是09的吧?我的03,03貌似没有默认是UFF。
其实我想知道这个仅仅只是定义了分子空穴的半径,不影响溶剂的其他参数吧?我怕高斯会默认是水的参数。...

我的是09的,但是定义应该是一样的。
既然你已经选择了溶剂,应该是不影响溶剂其他参数的。分子后面的输入部分只是对于你在命令行指定的操作的部分修改做说明,这是我的理解。
5楼2013-10-14 09:45:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 26年申博自荐-计算机视觉 20+3 光亮我自己 2026-05-01 4/200 2026-05-03 09:01 by lfy8008
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qs8kylt1wr 2026-05-01 4/200 2026-05-03 06:52 by jmr1kibhvw
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 3/150 2026-05-03 06:04 by jmr1kibhvw
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 d8tbypao1q 2026-05-01 4/200 2026-05-03 05:49 by w5idbsc3mz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 4/200 2026-05-03 05:04 by jmr1kibhvw
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 4/200 2026-05-03 04:34 by w5idbsc3mz
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 4/200 2026-05-03 04:19 by w5idbsc3mz
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 4/200 2026-05-03 03:49 by w5idbsc3mz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 4/200 2026-05-03 03:19 by w5idbsc3mz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 4/200 2026-05-03 03:04 by w5idbsc3mz
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 k17zww5nna 2026-05-01 4/200 2026-05-03 02:06 by w5idbsc3mz
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qs8kylt1wr 2026-05-01 4/200 2026-05-03 00:00 by 火炎焱燚炙烤
[考博] 考博 +4 Eternitf 2026-04-29 4/200 2026-05-02 16:10 by yejenny
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qs8kylt1wr 2026-05-01 3/150 2026-05-02 15:36 by zahslv263y
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 3/150 2026-05-02 14:21 by zahslv263y
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 3/150 2026-05-02 09:36 by dz7y1p1i98
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 5/250 2026-05-02 09:21 by dz7y1p1i98
[文学芳草园] 太白金星有点烦 +3 yexuqing 2026-04-27 3/150 2026-04-30 21:56 by myrtle
[基金申请] 收到国自然专家邀请后几年才会有本子送过来评 +3 barley5 2026-04-30 3/150 2026-04-30 14:58 by aspect3000
[论文投稿] 有没有快的中文核心比较快录用的,纳米材料光催化 5+3 2914439618 2026-04-27 4/200 2026-04-29 08:59 by 北京莱茵润色
信息提示
请填处理意见