应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » NAD和底物分子 两个配体怎么dock进一个蛋白质里？
51/1返回列表
查看: 1061  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

835598372

新虫 (小有名气)

[求助] NAD和底物分子 两个配体怎么dock进一个蛋白质里？

由于我的蛋白质需要辅酶NAD，底物分子和NAD怎么同时dock一个蛋白质里，请高手指点
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2013-10-08 22:13:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

835598372

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by fishhope at 2013-10-09 12:12:29
把NAD作为蛋白质的一部分进行格点文件的准备。

怎么吧NAD作为蛋白质的一部分啊，NAD和蛋白质文件是分开的
赞一下 回复此楼
3楼2013-10-09 19:09:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

fishhope

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把NAD作为蛋白质的一部分进行格点文件的准备。
赞一下 回复此楼
2楼2013-10-09 12:12:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fishhope

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
835598372: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-10-10 18:43:59
如果有同源蛋白质，结构比对之后，将同源蛋白质中的NAD的坐标拷过来。如果没有，可将NAD对接到apo蛋白质中。
赞一下 回复此楼
4楼2013-10-09 19:29:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
835598372: 金币+2 2013-10-10 18:44:04
现做NAD的对接 然后做配体的 因为辅酶结合的特异性很强 通常都能找到比较满意的位置 再去处理不那么靠谱的配体对接 直接找同源带白拷贝过来也行 不过有待进一步能量优化
赞一下 回复此楼
5楼2013-10-10 10:00:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭