24小时热门版块排行榜    

查看: 876  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

835598372

新虫 (小有名气)

[求助] NAD和底物分子 两个配体怎么dock进一个蛋白质里?

由于我的蛋白质需要辅酶NAD,底物分子和NAD怎么同时dock一个蛋白质里,请高手指点
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

835598372

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fishhope at 2013-10-09 12:12:29
把NAD作为蛋白质的一部分进行格点文件的准备。

怎么吧NAD作为蛋白质的一部分啊,NAD和蛋白质文件是分开的
3楼2013-10-09 19:09:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

fishhope

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把NAD作为蛋白质的一部分进行格点文件的准备。
2楼2013-10-09 12:12:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fishhope

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
835598372: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-10-10 18:43:59
如果有同源蛋白质,结构比对之后,将同源蛋白质中的NAD的坐标拷过来。如果没有,可将NAD对接到apo蛋白质中。
4楼2013-10-09 19:29:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
835598372: 金币+2 2013-10-10 18:44:04
现做NAD的对接 然后做配体的 因为辅酶结合的特异性很强 通常都能找到比较满意的位置 再去处理不那么靠谱的配体对接 直接找同源带白拷贝过来也行 不过有待进一步能量优化
5楼2013-10-10 10:00:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 278求调剂 +6 烟火先于春 2026-03-17 6/300 2026-03-21 01:57 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +10 冷笙123 2026-03-17 10/500 2026-03-21 01:54 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +6 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 7/350 2026-03-21 01:03 by JourneyLucky
[考研] 294求调剂材料与化工专硕 +15 陌の森林 2026-03-18 15/750 2026-03-20 23:28 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 323求调剂 +3 洼小桶 2026-03-18 3/150 2026-03-20 22:54 by JourneyLucky
[考研] 324求调剂 +5 lucky呀呀呀鸭 2026-03-20 5/250 2026-03-20 22:30 by 促天成
[考研] 288求调剂 +16 于海海海海 2026-03-19 16/800 2026-03-20 22:28 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +5 Mqqqqqq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:46 by zhukairuo
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +13 曦熙兮 2026-03-15 13/650 2026-03-20 19:35 by Dream007008
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[基金申请] 学校已经提交到NSFC,还能修改吗? 40+4 babangida 2026-03-19 8/400 2026-03-20 15:58 by babero
[考博] 申博26年 +3 八6八68 2026-03-19 3/150 2026-03-19 19:43 by nxgogo
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 6/300 2026-03-19 17:18 by fei626-918
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 化学工程321分求调剂 +15 大米饭! 2026-03-15 18/900 2026-03-18 14:52 by haxia
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历,论文在投 +7 腻腻gk 2026-03-14 7/350 2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
信息提示
请填处理意见