24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 892  |  回复: 4

835598372

新虫 (小有名气)

[求助] NAD和底物分子 两个配体怎么dock进一个蛋白质里?

由于我的蛋白质需要辅酶NAD,底物分子和NAD怎么同时dock一个蛋白质里,请高手指点
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fishhope

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把NAD作为蛋白质的一部分进行格点文件的准备。
2楼2013-10-09 12:12:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

835598372

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fishhope at 2013-10-09 12:12:29
把NAD作为蛋白质的一部分进行格点文件的准备。

怎么吧NAD作为蛋白质的一部分啊,NAD和蛋白质文件是分开的
3楼2013-10-09 19:09:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fishhope

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
835598372: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-10-10 18:43:59
如果有同源蛋白质,结构比对之后,将同源蛋白质中的NAD的坐标拷过来。如果没有,可将NAD对接到apo蛋白质中。
4楼2013-10-09 19:29:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
835598372: 金币+2 2013-10-10 18:44:04
现做NAD的对接 然后做配体的 因为辅酶结合的特异性很强 通常都能找到比较满意的位置 再去处理不那么靠谱的配体对接 直接找同源带白拷贝过来也行 不过有待进一步能量优化
5楼2013-10-10 10:00:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 835598372 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿北理工298英一数二求调剂 +10 Reframe 2026-04-10 11/550 2026-04-10 13:18 by forestmumu
[考研] 314求调剂 +22 wakeluofu 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 12:08 by pengliang8036
[考研] 071000生物学调剂求助 +15 zzzzwww 2026-04-09 18/900 2026-04-10 12:03 by pengliang8036
[考研] +6 化工专硕323分 2026-04-04 6/300 2026-04-10 10:04 by may_新宇
[考研] 还有化工二轮调剂的学校吗 5+11 化工人999 2026-04-09 42/2100 2026-04-10 09:42 by 690616278
[考研] 301求调剂 +4 XYPLR 2026-04-05 6/300 2026-04-10 09:17 by Delta2012
[考研] 计算机11408,286分求调剂 +9 木子念晞 2026-04-05 9/450 2026-04-09 20:04 by vgtyfty
[考研] 266求调剂,一志愿哈工程电子信息,本科获多项国奖和省奖 +4 lumine1 2026-04-06 4/200 2026-04-09 17:38 by vgtyfty
[考研] 材料299专硕求调剂 +10 +21 2026-04-09 10/500 2026-04-09 17:34 by 1753564080
[考研] 083200 初试305分 求调剂 暂不考虑跨专业 +15 Claireyyyy 2026-04-09 15/750 2026-04-09 16:11 by zhuimr
[考研] 274求调剂 +5 山阿蔓 2026-04-07 5/250 2026-04-09 15:28 by 18828373951
[考研] 070300化学学硕311分求调剂 +18 梁富贵险中求 2026-04-04 20/1000 2026-04-09 11:18 by 哒哒哒呱呱呱
[考研] 专硕310求调剂 +7 捞捞我…. 2026-04-04 8/400 2026-04-08 20:24 by yutian743
[考研] 农学,求调剂,314分 +4 访客记录可爱 2026-04-04 4/200 2026-04-07 21:07 by 等岸
[考研] 312求调剂 +18 gtw1 2026-04-06 20/1000 2026-04-07 18:16 by 蓝云思雨
[考研] 334分机械专硕求调剂 +3 蛋花紫菜汤 2026-04-03 3/150 2026-04-07 14:49 by 逍遥cocoa
[考研] 316求调剂 +7 yyx想调剂 2026-04-05 7/350 2026-04-07 14:31 by shdgaomin
[考研] 机械专硕274求调剂,不挑专业学校 +6 泛泛2333 2026-04-05 8/400 2026-04-06 18:06 by 泛泛2333
[考研] 331求调剂 +8 于征yz 2026-04-05 8/400 2026-04-06 00:54 by fmesaito
[考研] 化工求调剂 +11 荔香芝士椰奶 2026-04-03 11/550 2026-04-03 22:06 by 啵啵啵0119
信息提示
请填处理意见