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周啸

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 28 (小学生)
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虫号: 816772
注册: 2009-07-27
专业: 金属材料的微观结构

[求助] 求助lammps晶界建模如何保持box的周期性~~

求助各位专家虫友，我用lammps建立了sigma13<100>晶界，如图所示，但是box的大小是我自己随便取的，因此在盒子的edge上的原子不是周期性排布的，如图白色原子所示，请问大家我应该如何确定盒子的大小使其边界上的原子也满足周期性排列呢？万分感谢大家帮助啊！！！！！！

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爱拼才会赢

1楼 2013-10-04 07:51:54

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

liwl926

金虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
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性别: GG
专业: 理论和计算化学

引用回帖:

6楼: Originally posted by zhangliang8 at 2013-10-06 18:18:41
模型建立好后可以选择用minimization命令，也可以直接在特定温度下run一段时间，已达到晶界的平衡结构。但是这不是你问题的主要原因，问题是你建box的时候尺寸是任意选取的，即使你在x方向上用的周期边界条件也会出 ...

我有另一个问题，建立一个晶胞，如何才能使其优化（使晶胞参数发生改变）找到最优构型？fix box/relax命令可以吗？