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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 做了质粒电泳并且测了样本OD值，算出来的样品浓度为何差了一个数量级？
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Diana905

新虫 (初入文坛)

[求助] 做了质粒电泳并且测了样本OD值，算出来的样品浓度为何差了一个数量级？

对pUC18和pEC2.1两个质粒进行了电泳实验，用imagej软件对电泳胶照片进行了intensity analysis，marker DNA含量0.25μg，一共十一条条带故每条DNA含量约23ng，pUC18样品条带与marker相关条带intensity比值1.875695705
，pEC2.1样品条带与marker相关条带intensity比值5.385783806
，以此数据算得pUC18 DNA浓度0.0426μg/μl，pEC2.1浓度0.122μg/μl。（跑胶用样品1μl）

然而做OD值的时候测得pUC18在260nm处od为0.193，pEC2.1为0.410。根据50μg/ml DNA在260nm处od为1计算得pUC18 DNA浓度0.00965μg/μl，pEC2.1浓度0.0205μg/μl。

为何会差这么多？
做了质粒电泳并且测了样本OD值，算出来的样品浓度为何差了一个数量级？
gel photo label.jpg
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1楼 2013-10-03 12:35:56
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sylar1022

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 谢谢参与 2013-10-04 06:29:53
Marker每天带含量是不同的，有几条指示带是比较多的…  而且测od也不一定准的，会受很多因素影响，质粒的纯度什么的也不一样… 看你跑的第二条质粒上面好像还有一条带?

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2013-10-03 17:39:14
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Diana905

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sylar1022 at 2013-10-03 17:39:14
Marker每天带含量是不同的，有几条指示带是比较多的…  而且测od也不一定准的，会受很多因素影响，质粒的纯度什么的也不一样… 看你跑的第二条质粒上面好像还有一条带?

上面有两条带，应该是质粒conformation不同造成的……
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3楼2013-10-04 10:25:43
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