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请问“In silico aided metabolic engineering”是什么技术 已有2人参与
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| 请问“In silico aided metabolic engineering”是什么技术，能不能讲下大概的实验流程？ |
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铁杆木虫 (职业作家)
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2楼2013-09-30 20:42:46
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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| 就是基于计算机辅助的代谢工程，所需要的是代谢工程改造宿主的全基因组规模代谢网络模型（genome scale metabolic model, GSMM），通常大家代谢工程所用的宿主是大肠杆菌和酿酒酵母，这两种生物的GSMMs已经构建的十分完整，可以直接在别人发表的模型基础上做略微的修改然后使用。如果你改造的生物没有发表的GSMM，那么需要你自己在基因组序列基础上构建其GSMM。得到GSMM后利用很多种软件，常用的算法有optknock，optflux，optstain等等很多，可以设计代谢工程操作的靶点，预测代谢工程改造后宿主的一些变化。这种技术首先由韩国的Lee SY提出，现在在大肠杆菌的代谢工程中有较多的成功事例，也发在较高水平的杂志。同时这种技术也可用于合成生物学中，在人工设计完细胞途径后，可以先用所设计细胞的GSMM模拟其代谢性能，以便提高改造的方向性和效率！ |
3楼2013-10-01 08:44:46