| 查看: 467 | 回复: 2 | |||
[交流]
请问“In silico aided metabolic engineering”是什么技术 已有2人参与
|
| 请问“In silico aided metabolic engineering”是什么技术，能不能讲下大概的实验流程？ |
回复此楼» 猜你喜欢
重要来源：本周末出结果
已经有3人回复
-
FileCode能看出啥？
已经有23人回复
-
应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键
已经有36人回复
-
关于Filecode分析方法
已经有9人回复
-
2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B?
已经有10人回复
-
不应该看fileCode
已经有6人回复
-
好奇怪的filecode
已经有6人回复
-
长年满屏的广告，版主太不责任了。基金也等的急
已经有4人回复
-
filecode
已经有15人回复
-
职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊
已经有4人回复
1989青苹果
铁杆木虫 (职业作家)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 8434.4
- 散金: 6351
- 红花: 10
- 帖子: 3658
- 在线: 400.8小时
- 虫号: 2165918
- 注册: 2012-12-04
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
2楼2013-09-30 20:42:46
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
| 就是基于计算机辅助的代谢工程，所需要的是代谢工程改造宿主的全基因组规模代谢网络模型（genome scale metabolic model, GSMM），通常大家代谢工程所用的宿主是大肠杆菌和酿酒酵母，这两种生物的GSMMs已经构建的十分完整，可以直接在别人发表的模型基础上做略微的修改然后使用。如果你改造的生物没有发表的GSMM，那么需要你自己在基因组序列基础上构建其GSMM。得到GSMM后利用很多种软件，常用的算法有optknock，optflux，optstain等等很多，可以设计代谢工程操作的靶点，预测代谢工程改造后宿主的一些变化。这种技术首先由韩国的Lee SY提出，现在在大肠杆菌的代谢工程中有较多的成功事例，也发在较高水平的杂志。同时这种技术也可用于合成生物学中，在人工设计完细胞途径后，可以先用所设计细胞的GSMM模拟其代谢性能，以便提高改造的方向性和效率！ |
3楼2013-10-01 08:44:46
