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下雨没有伞银虫 (小有名气)
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关天T载体中蓝白斑的问题
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本人最近做T载体实验,做了几次都没有成功,现和各位大侠交流求教。 最近一次的实验困扰: 细菌复苏后分别铺菌和摇菌----铺菌出现白斑和蓝斑,白斑大于50% ----摇菌菌液也变浑浊了。 下一步:挑白斑划线----划了三个平板,均无细菌生长 分析:挑白斑少了。白斑太小 下一步:从冰箱取出再培养了4小时(蓝白斑平板) 挑白斑划线----一次取二到5个白斑划一个平板,共计划三个平板 结果还是无细菌生长,有一个全是蓝斑 分析:挑菌时有可能挑到蓝斑,对摇菌试管进行细菌扩增。 下一步:对摇菌试管取10ul加2mlLB+2ulAMP进行再摇菌扩增 下一步:对摇菌试管和扩增的试管各取100ul用煮沸法用目的片段的引物 PCR进行验证,电泳加目的DNA作阳性对照和Maker,结果有和阳性对照一样 的条带。 下一步:对扩增的试管进行铺菌----分别10^3,2*10^3,4*10^3的稀释倍数 三个平板,结果三个平板均是蓝斑,无白斑。 困扰的问题: 1 第一次有蓝白斑,为何划线分不出白斑?摇菌培养过,液体清亮。 2 验证有目的DNA片段的存在,后续铺菌中为何全是蓝斑? 我的分析: 1白斑可能是其它DNA片段污染---但是即使污染,划线也应该有白斑出现呀 ----有没有不含DNA片段的白斑呢?----按蓝白斑筛选的原理是不可能的呀 2验证细菌中有目的DNA片段的存在,铺菌全是蓝斑,可能目的片段的细菌 含量太少,没有出现,----但是三个平板都没有白斑,可能性太小了 3LB平板的配制有问题,我只想到出现了蓝斑那么X-GAL和IPTG应该没有问题, AMP是否有影响还不清楚。 请教各位有经验的朋友们帮我分析一下呀,我快被骂死了,做了这么久没有做出来 |
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下雨没有伞
银虫 (小有名气)
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10楼2013-09-23 21:11:18
yudaoqian88
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楼主逻辑好强,看的我最后有点小乱了,仅就最后一些个人感觉发表点小看法哈! 1) 涂板有不长菌,应该抗生素是没有问题的。涂板后有蓝斑,表明X-GAL和IPTG也没有问题,应该不是试剂出了错; 2) 蓝白斑筛选过程是有假阳性情况出现的,即使长了白班,也不一定是自己的目标质粒。有可能是PCR非特异扩增小片段(电泳无法检测到)的连接产物,但这种情况,一般菌液PCR就可以检测到并排除; 3)蓝斑有时候可能会是目标产物,蓝白斑筛选应该是插入片段破坏了载体自身的读码框,如果片段不大,或者片段插入未能改变读码框,就很有可能出现蓝色阳性克隆。 4) 可以加长菌体在平板上的培养时间,让菌斑长大一点,同时加长菌板在冰箱的诱导时间,这样显色比较方便观察和排除。 暂时就这些吧,别的原因我也不大清楚,不过看楼主的意思,已经得到阳性克隆了,为何还要铺板子?直接送公司测序就好了;还有就是,画线培养就是为了纯化菌斑的,如果挑4-5个画个板子,有点绕圈子了! 祝好,大家相互学习,共同进步! |

2楼2013-09-14 14:06:27
cicelyzh
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4楼2013-09-16 17:17:49













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