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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 求助 STR结果的 TRFLP 数据分析
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龙小娴

银虫 (小有名气)
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9楼: Originally posted by better2023 at 2013-09-16 20:00:12
我只是为了测序才用这个的：我有很多个克隆，全部测太贵不现实，于是用T-RFLP找出序列不同的，相同的测一个就行了
所以我对这个也只是粗略的了解，最好的办法就是多读文献，带着问题去读，我相信你能搞定的...

谢谢
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11楼2013-09-17 17:26:34
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龙小娴

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by better2023 at 2013-09-13 02:29:08
没有结果的原因可能是因为off scale，就是样品浓度太高，超过纵坐标量程了；可以把height和are里面太大的数字人为改小点

这个是网站的问题貌似，偶尔不太好用，可能是我点的太快，现在的浓度还是可以的
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12楼2013-09-17 17:28:35
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龙小娴

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by kiruwa at 2013-09-17 00:34:57
不做克隆文库怎么能知道菌种信息,要我是审稿人你不做克隆文库我立马就枪毙这篇文章.你这个TRFLP结果不是很好,很多小峰,这些很可能是dimer.

做克隆文库是不是比较费时费力，没有做过，看过一些文献介绍的不清楚估计还得看相关书籍，如果不建库只从TRFLP结果分析，都可以得什么结果呢？谢谢
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13楼2013-09-17 17:31:07
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better2023

金虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 龙小娴 at 2013-09-17 17:31:07
做克隆文库是不是比较费时费力，没有做过，看过一些文献介绍的不清楚估计还得看相关书籍，如果不建库只从TRFLP结果分析，都可以得什么结果呢？谢谢...

多看文献吧，我也是摸着石头过河呢
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14楼2013-09-17 18:14:22
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龙小娴

银虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by better2023 at 2013-09-17 18:14:22
多看文献吧，我也是摸着石头过河呢...

15楼2013-09-17 19:39:32
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by better2023 at 2013-09-15 17:37:10
能重复最好了，不重复的话得到的结果不太精确。
Height和Area代表了某个片段出现概率的大小
所以要是不重复的话，能知道样品中有哪些片段，但是不知道具体片段占的比例
图片中我不是用的这个软件，也不知道怎么 ...

您好 我的t-rflp的数据刚出来 现在不知道如何分析 做了一个单酶切的 一个双酶切的 请问如何分析，谢谢
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16楼2014-12-04 21:41:12
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416114799

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
10楼: Originally posted by kiruwa at 2013-09-17 00:34:57
不做克隆文库怎么能知道菌种信息,要我是审稿人你不做克隆文库我立马就枪毙这篇文章.你这个TRFLP结果不是很好,很多小峰,这些很可能是dimer.

您好，请教一下，我看了有些文献对功能基因的片段长度计算时，把30以上就纳入了。有文献说一般是50-500可靠。那么实际情况到底如何？此外，比如101,103,105,107都有峰，这算作4个片段长度还是有些是误差的，可以把他们叠加在一起？
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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
17楼2014-12-27 15:08:42
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