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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 求助 STR结果的 TRFLP 数据分析
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龙小娴

银虫 (小有名气)

[求助] 求助 STR结果的 TRFLP 数据分析

在生工做了STR返回了数据不知道怎么分析，在论坛看了之前有人求助，有虫友说用mica还有T-REX网站，mica提交后总出现HTTP 404没有结果，T-REX要提交一个labels file ，生工返回的数据只是峰图和raw data file，labels file不知道怎么写，求高人指点。
另外听说bio-dap也可以分析网上也没有找到使用说明。
求助 STR结果的 TRFLP 数据分析
11.jpg


求助 STR结果的 TRFLP 数据分析-1
22.jpg
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1楼 2013-09-12 16:32:29
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416114799

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
10楼: Originally posted by kiruwa at 2013-09-17 00:34:57
不做克隆文库怎么能知道菌种信息,要我是审稿人你不做克隆文库我立马就枪毙这篇文章.你这个TRFLP结果不是很好,很多小峰,这些很可能是dimer.

您好，请教一下，我看了有些文献对功能基因的片段长度计算时，把30以上就纳入了。有文献说一般是50-500可靠。那么实际情况到底如何？此外，比如101,103,105,107都有峰，这算作4个片段长度还是有些是误差的，可以把他们叠加在一起？
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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
17楼2014-12-27 15:08:42
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better2023

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
龙小娴: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-09-13 13:21:49
没有结果的原因可能是因为off scale，就是样品浓度太高，超过纵坐标量程了；可以把height和are里面太大的数字人为改小点
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3楼2013-09-13 02:29:08
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龙小娴

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by better2023 at 2013-09-13 02:29:08
没有结果的原因可能是因为off scale，就是样品浓度太高，超过纵坐标量程了；可以把height和are里面太大的数字人为改小点

改小是不是结果就不对了，实验是要重做的吧，另外这几项怎么填写呢？
求助 STR结果的 TRFLP 数据分析-2
mica.jpg
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4楼2013-09-13 12:35:46
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龙小娴

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by better2023 at 2013-09-13 02:29:08
没有结果的原因可能是因为off scale，就是样品浓度太高，超过纵坐标量程了；可以把height和are里面太大的数字人为改小点

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5楼2013-09-14 10:27:01
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