| 查看: 3841 | 回复: 37 | |||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||
小雨莎莎木虫 (正式写手)
|
[求助]
请教如何进行多肽与蛋白结合的过程中，多肽上关键氨基酸的预测？
|
||||
| 请教一下各位虫友，不知道有没有做过蛋白或者多肽结构运算或者是预测的，我现在筛选到一条多肽，只有十来个氨基酸，完全是随机序列，没有ｃｙｓ来固定一个闭合环。这个多肽能够与一个特定的靶蛋白结合，然后我想做改造，希望能优化它与靶点的结合情况比如说想增强亲和力，想提高其生理功能，考虑想要预测一下或者计算模拟一下在这十五个氨基酸中，哪些氨基酸是对结合有很重要的作用的，请问该怎么做呢？有没有什么软件，还是说需要通过做生物信息学研究的老师帮忙才能做出来？谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
求调剂院校
已经有5人回复
-
299求调剂
已经有7人回复
-
282求调剂
已经有7人回复
-
化工335求调剂
已经有4人回复
-
298求调剂
已经有14人回复
-
成果系统访问量大，请15分钟后再尝试。由此给您造成的不便，敬请谅解。
已经有8人回复
-
课题组接收材料类调剂研究生
已经有6人回复
-
338求调剂
已经有5人回复
-
11408，学硕276求调剂
已经有5人回复
-
材料化工调剂
已经有16人回复
凌波丽
专家顾问 (知名作家)
-
专家经验: +218 - BioEPI: 11
- 应助: 397 (硕士)
- 贵宾: 0.044
- 金币: 2118.9
- 散金: 10
- 红花: 208
- 帖子: 5633
- 在线: 571.6小时
- 虫号: 1766465
- 注册: 2012-04-19
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
- 管辖: 生物科学综合
【答案】应助回帖
|
点突变多肽是一般可行的，突变掉多肽后对于多肽-蛋白质的相互作用的检测并不能指示出蛋白质分子表面的多肽-蛋白质的相互作用的具体位点，只能指示出多肽上的与蛋白质的相互作用的具体位点。 试验检测多肽-蛋白质的相互作用或者蛋白质-蛋白质的相互作用的方法很多，如果让我做，我不会使用噬菌体展示检测，而会使用更省事的一组试验方法，点突变后的多肽-蛋白质的相互作用的检测，我也不会用噬菌体展示检测；对于蛋白质点突变而后，用实验方法多肽-蛋白质的相互作用，出于更加严谨的试验流程，可以在最后一步执行，不过不使用噬菌体展示检测，太麻烦。 你的课题用不着分子对接软件，具体材料（包括预测+试验检测）我昨天已经把草稿写完了，今天交到文印室去录入，我自己没有时间录入，内容比较多，录入完我会修改补充，下周正回复你这贴。以上问题我会在正式回复中提出自己的protocols,现在不回答是因为我考虑可能会有更好的protocols。 |
22楼2013-09-10 08:29:24
小雨莎莎
木虫 (正式写手)
- BioEPI: 1
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 3662.2
- 散金: 6
- 红花: 6
- 帖子: 994
- 在线: 381.2小时
- 虫号: 1281496
- 注册: 2011-04-29
- 性别: MM
- 专业: 细胞增殖、生长与分化
2楼2013-09-04 19:39:59
shale1983
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 162 (高中生)
- 金币: 6684.9
- 散金: 1
- 红花: 13
- 帖子: 850
- 在线: 879.3小时
- 虫号: 1082367
- 注册: 2010-08-26
- 性别: GG
- 专业: 物理无机化学
3楼2013-09-04 22:15:27
小雨莎莎
木虫 (正式写手)
- BioEPI: 1
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 3662.2
- 散金: 6
- 红花: 6
- 帖子: 994
- 在线: 381.2小时
- 虫号: 1281496
- 注册: 2011-04-29
- 性别: MM
- 专业: 细胞增殖、生长与分化
4楼2013-09-04 22:18:06
5