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grexx213

木虫 (正式写手)

[求助] 求助——如何用Chem3D/ChemBio3D计算过渡态的能量?

偶是有机出身,不懂计算,所以我尽量讲得明白些。

有三个化合物,ABC,A是底物,B、C是催化剂,产物都是一样的。用B和用C的时候反应速度有差别,我们推测可能是中间过渡态 A+B 和 A+C 能量不一样,所以一个快一个慢。

俺们实验室没有专门用来计算的电脑,所以想用Chem3D/ChemBio3D粗略计算一下(过渡态大概有60个原子)。

问题如下:
1,在Chem3D/ChemBio3D里应该用什么软件来计算?MM2、GAMESS、Jaguar还是MOPAC?
2、计算A+B 和 A+C 两个过渡态的时候需不需要指定氢键、静电吸引等相互作用?

多谢大牛指点!!!
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ufo1977 at 2013-09-21 11:34:23
现在不负责乱说话的人好多啊,哎!~~

英雄所见略同啊.
9楼2013-09-21 13:02:58
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-03 08:11:29
grexx213: 金币+50, ★★★很有帮助 2013-09-10 23:52:23
别试了, Chem3D就是干这个事的
2楼2013-09-03 06:59:53
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grexx213

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2013-09-03 06:59:53
别试了, Chem3D就是干这个事的

那个,能不能麻烦你讲一下?我看得有点糊涂,“Chem3D就是干这个事的”是什么意思?多谢!
3楼2013-09-03 10:58:20
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by grexx213 at 2013-09-03 10:58:20
那个,能不能麻烦你讲一下?我看得有点糊涂,“Chem3D就是干这个事的”是什么意思?多谢!...

昏, 少了个字.
Chem3D就不是干这个的, 你别试了
4楼2013-09-03 11:05:55
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