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33ggdf

新虫 (小有名气)

[求助] 酶切连接 (难题一个接一个呀)

我在做Sac1和Xho1的双酶切连接(这两个酶切位点应该没啥问题吧 ?),分别用这两个酶对表达载体和T载体进行双酶切过夜(NEB的酶 标注说过夜不会产生星活性),T载体上我还加了保护碱基,然后分别切胶回收表达载体的大片段和T载体上的目的片段(两个片段都很亮,大小也合适,大片段约16k,目的片段1100bp),大片段浓度是150纳克/微升,小片段是33纳克/微升,然后做连接(连接是用的NEB的普通连接酶,16度16小时),共20微升体系(1微升连接酶,连接酶我用的是新的;2微升10×连接buffer,也换过新的; 共做了三个比例即大片段与目的片段两者的摩尔比是1:6  1:10   和1:15),再进行热击转化涂皿,分别做了阳性对照(很多单菌落)和阴性对照(无单菌落)可以证明感受态及转化过程没问题,双酶切也成功。可为什么我的连接反应却一个单菌落也长不出来呢(抗性和浓度也没问题),哪位高人帮帮忙???最近快烦死了。。。。。
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因为吃饭

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+5, 鼓励交流 2013-09-04 16:35:37
载体自连的话那应该会长菌才对,但是楼主没长啊。
我最近也做转化,13k的载体和1400bp的片段,试了很多连接方法,也做了各种对照,takara的、neb的酶都试过了,连过夜,快连,还用重组酶,也总是没有菌。
现在做了3个星期了,上一批的终于长了3个出来了,今天做菌p。希望能有阳性。
说了这么多,就是多做,如果其他没问题,总会做出来的。另外实验的一些小细节要多注意,因为这么大的载体做转化,效率本来就很低,要是细节不注意的话,就很难长出来了。
辩证。
12楼2013-09-04 16:00:48
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suhsia

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待更详细的解答 2013-08-31 18:20:44
33ggdf: 金币+1 2013-09-02 08:16:37
换个人做一下就行了,克隆这东西手气很重要,没设么技术含量的

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2013-08-31 16:23:24
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cr507

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
33ggdf: 金币+1 2013-09-02 08:16:45
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-09-04 16:34:57
首先用这两个酶做双酶切是不合适的,它们产生相同的粘性末端,跟单酶切没什么分别,理论上会导致大量的载体自连。另外建议楼主缩短酶切时间试试,NEB的酶按说明书的体系切2小时就足够了。其他应该没什么问题,祝好运!
3楼2013-09-01 21:22:30
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ykluuniu

金虫 (小有名气)


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-04 16:35:18
gyesang: 回帖置顶 2013-09-04 21:52:20
引用回帖:
3楼: Originally posted by cr507 at 2013-09-01 21:22:30
首先用这两个酶做双酶切是不合适的,它们产生相同的粘性末端,跟单酶切没什么分别,理论上会导致大量的载体自连。另外建议楼主缩短酶切时间试试,NEB的酶按说明书的体系切2小时就足够了。其他应该没什么问题,祝好运 ...

不同的酶,切出来的是不同的粘性末端,为什么和单酶切没有区别呢?你说的显然是不对的。
载体自连可能是因为双酶切过程中,有一个酶酶切不彻底的缘故。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2013-09-01 22:46:12
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