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转基因猴子

木虫 (正式写手)

[求助] 做分子模拟电脑配置

本人想买台电脑,以后会做到分子模拟。请问电脑大致配置要怎样的?
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我还年轻,我要上路!
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
转基因猴子: 金币+4 2013-09-02 09:12:47
让你导师买服务器吧,个人电脑搞不定的
2楼2013-08-30 16:40:59
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bugakbug

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
转基因猴子: 金币+4 2013-09-02 09:12:52
其实还好,学弟用双核心笔电也用 DS 2.5在做 Z-dock
(几万笔数据在跑,结果跑出来需要一星期左右)
显卡稍微挑好一点的
至少DS跑完要看图不会太卡。

当然最好还是挑桌上型计算机
(现在市面上有虚拟八核心/实体四核心,显卡可能配置绘图专业等级的)
价格上的考虑,况且也不会随时带着笔电做分子模拟吧
顶多打开结果的图来做不同的呈现。
以上花费约几千人民币

当然,如果您的数据库很大,又需要迅速得出结果
还是考虑服务器架设,这笔钱只能让老师的计划资金出了
学生应该花不起几万~几十万的人民币
3楼2013-08-31 08:22:43
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wally8962

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
转基因猴子: 金币+4 2013-09-02 09:12:57
看你的软件在什么样的硬件上跑得快
desktop其实也能做些事
4楼2013-08-31 15:29:24
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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转基因猴子: 金币+4 2013-09-02 09:13:01
可以买i7+独显的本子,算算小体系熟悉help的操作,看看服务器的模拟结果,平时用用够了
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2013-09-02 09:00:21
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转基因猴子

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by pigrass at 2013-09-02 09:00:21
可以买i7+独显的本子,算算小体系熟悉help的操作,看看服务器的模拟结果,平时用用够了

这位虫子,我还想问下,我要计算RMSD,RMSF,SASA等值,使用VMD 和Gromacs或者Amber,可以使用windows系统吗?一定要使用linux系统吗?哪个更好一点?
我还年轻,我要上路!
6楼2013-09-02 09:23:06
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

引用回帖:
6楼: Originally posted by 转基因猴子 at 2013-09-02 09:23:06
这位虫子,我还想问下,我要计算RMSD,RMSF,SASA等值,使用VMD 和Gromacs或者Amber,可以使用windows系统吗?一定要使用linux系统吗?哪个更好一点?...

一般来说,linux的运行效率会比windows高
对速度没要求,体系小又有windows程序的话,可以试试windows
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
7楼2013-09-02 09:33:59
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yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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转基因猴子: 金币+4, ★★★★★最佳答案, 明白了 2013-09-02 12:43:40
引用回帖:
6楼: Originally posted by 转基因猴子 at 2013-09-02 09:23:06
这位虫子,我还想问下,我要计算RMSD,RMSF,SASA等值,使用VMD 和Gromacs或者Amber,可以使用windows系统吗?一定要使用linux系统吗?哪个更好一点?...

多数纯学术软件如果你想在windows用其实比linux下更麻烦 还要用一个中间层在wiin下去模拟linux运行 最后软件还是运行在命令行的 折腾半天真没任何意义 不仅慢得要死 你还要考虑很多兼容问题 又学不到东西 如果是商业软件 视优化程度可以考虑用win版本的 但是一般来说 真正计算的软件没有原生在win下开发的 linux下的开发优势非常大 由于多数不需要考虑界面就只考虑速度 linux是首选
8楼2013-09-02 10:04:16
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