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袁庭

金虫 (正式写手)

[求助] 吸附过程中原子跑到金属层版中去了怎么办

我在共吸附的计算过程中,发现共吸附模型在优化过程中,原子跑到了层板里面去了,如下图:黄色原子和褐色分子的共吸附模型,在优化过程中,黄色原子和褐色分子距离逐渐变远,黄色的原子跑到了金属层板的里面去了,我看出现这样的情况就把计算给停掉了,没有继续计算下去~具体参数是考虑了底层金属固定,上两层原子自由移动的情况
    我想请问下各位有没有遇到过这样类似的情况?是否正常?如果不正常的话改如何改变呢?
吸附过程中原子跑到金属层版中去了怎么办
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吸附过程中原子跑到金属层版中去了怎么办-1
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martin2572

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-08-11 18:28:34
没弄过这个,但算过别的MD
是物理上会出现?还是初始条件设置的问题?
是不是势场不对造成原子跑进去了?
8楼2013-08-11 11:48:26
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晨光逐鹿

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-08-11 18:28:26
我是门外汉,你能不能尝试一下用静电把原子吸下来?
好好工作
6楼2013-08-11 11:19:12
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袁庭

金虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by martin2572 at 2013-08-11 11:48:26
没弄过这个,但算过别的MD
是物理上会出现?还是初始条件设置的问题?
是不是势场不对造成原子跑进去了?

我相同的参数,就这个模型出问题了。。。但是我现在就需要用这个模型。。
9楼2013-08-11 11:58:12
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newsongs

铁虫 (初入文坛)

这个不知道,,,,
11楼2013-08-11 13:19:55
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