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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs编译安装
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Y224365

木虫 (小有名气)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
export MPICCDIR=/home/dzy_gros/lammpi/bin
export CXX=mpic++
export CC=mpicc
export FFTW_LOCATION=/home/dzy_gros/fftw
tar -zxvf gromacs-5.0.3.tar.gz
mkdir /home/dzy_gros/gromacs
cd /home/dzy_gros/gromacs
cmake ../gromacs-5.0.3/  \-DFFTW_INCLUDE_DIR=$FFTW_LOCATION/include \-DFFTW_LIBRARIES=$FFTW_LOCATION/lib/libfftw3f.a \-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$(pwd) \-DGMX_X11=OFF \-DCMAKE_CXX_COMPILER=$MPICCDIR/mpic++ \-DCMAKE_C_COMPILER=$MPICCDIR/mpicc \-DGMX_MPI=ON \-DGMX_PREFER_STATIC_LIBS=ON
make
make install
这样编译，报错：
Could not find fftw3f library named libfftw3f, please specify its location in CMAKE_PREFIX_PATH or FFTWF_LIBRARY by hand (e.g. -DFFTWF_LIBRARY='/path/to/libfftw3f.so')
CMake Error at cmake/gmxManageFFTLibraries.cmake:76 (MESSAGE):
  Cannot find FFTW 3 (with correct precision - libfftw3f for mixed-precision
  GROMACS or libfftw3 for double-precision GROMACS).  Either choose the right
  precision, choose another FFT(W) library (-DGMX_FFT_LIBRARY), enable the
  advanced option to let GROMACS build FFTW 3 for you
  (-GMX_BUILD_OWN_FFTW=ON), or use the really slow GROMACS built-in fftpack
  library (-DGMX_FFT_LIBRARY=fftpack).
Call Stack (most recent call first):
  CMakeLists.txt:738 (include)
怎么解决
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11楼2015-05-05 22:01:57
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cuoce

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我想用cygwin安装gromacs，安装过程如下：
将安装包拷贝到了home/xing里面；
tar xvzf cmake-3.6.2.tar.gz
cd cmake-3.6.2
./bootstrap

运行一段时间之后出现如下问题：
CMake Error: Could not find CMAKE_ROOT !!!
CMake has most likely not been installed correctly.
Modules directory not found in
/home/xing/cmake-3.6.2
CMake Error: Error executing cmake::LoadCache(). Aborting.

---------------------------------------------
Error when bootstrapping CMake:
Problem while running initial CMake
---------------------------------------------
请问这个问题该如何解决啊？网上看了很多教程，说是什么安装路径选择不对，这方面没有经历，请问怎么弄呀，谢谢啦。
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12楼2017-10-22 22:18:18
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