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aust

金虫 (正式写手)

一只老虫

[求助] 质粒转化后鉴定的问题

我前几天扩增了一个目的基因,把它连接到克隆载体后,转化DH5α,铺板(LB+AMP)。挑取单克隆后摇菌,取2μl为模板进行PCR鉴定,结果为阳性,条带大小完全符合预期目标,然后送测序,并同时-70C保种。测序结果提示是空载,不含目的基因。我把保种菌液复苏后重新划线接种,单克隆一样长的很好,再次挑取后摇菌并PCR鉴定,结果却成阴性了。而且更奇怪的是我同时还把以前保种的菌液也复苏做了PCR鉴定,却也成阴性了。请问哪位高手能帮我解释一下,为何保种前能P出来,保种后复苏就P不出来了?
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随风而过

银虫 (小有名气)

★ ★
aust(金币+2,VIP+0):谢谢!
1.确定你的过程条件有没有改变.
2.多筛点阳性菌落看能不能找到
3.从结果看很有可能是在做PCR鉴定时受到污染结果出现“假阳性”如果可以,我建议重头做,每一步都要做验证就知道问题出在那了
不知道你做PCR的时候有没有做阳性对照?
2楼2007-11-05 15:32:20
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aust

金虫 (正式写手)

一只老虫

我后来挑了30个单克隆菌落作的菌落PCR,但全为阴性。所有的反应体系及反应条件均未变。现在开始从头做了,谢谢!不知道有没有虫虫们也遇到过类似的情况?
3楼2007-11-09 16:49:06
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hn_zht

铁虫 (著名写手)


aust(金币+1,VIP+0):谢谢你的回复
很遗憾的告诉你:
1.你的AMP浓度是否是100μlAMP 加入100ml的LB中?及AMP的浓度是否合适
2.你验证的时候挑选的刚好是阳性克隆,其他是阴性的但菌已经有AMP抗性
3.是否是你的蒸馏水污染了目的基因?缓冲夜呢
欢迎加入糖生物技术群:177364074
4楼2007-11-09 20:08:18
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