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youyou8285

铁虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

应该是富集后获得了相近菌的群落，不是单一菌株。这种现象很普遍，可能存在基因水平转移造成

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11楼2013-07-30 16:39:26

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圣迭戈

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11楼: Originally posted by youyou8285 at 2013-07-30 16:39:26
应该是富集后获得了相近菌的群落，不是单一菌株。这种现象很普遍，可能存在基因水平转移造成

有可能是这样，但是测了20多个序列都不同，应该不至于每个序列都是一株单独的菌吧？所以我觉得有可能是实验误差或者测序误差，但不确定是哪步，所以需要有经验的大牛指导指导。

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12楼2013-07-30 17:39:09

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10楼: Originally posted by hkqgeoffrey at 2013-07-30 12:55:42
16S方法中同源性>=97%,通过构建系统同源进化树位于同枝，数值 >73 ，采用NJ或ML两种以上方法进化树稳定就可以基本判定同种了，如果不放心可以再通过生理生化或其他方法辅助鉴定

因为我是想得到一个新种，根据文献报道好像是要序列完全一样才可以。只是判定为同种可能还不够。

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13楼2013-08-02 12:58:04

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