24小时热门版块排行榜    

查看: 5003  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mambatu

金虫 (小有名气)

[求助] The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库的使用? 已有3人参与

会用The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库的虫子麻烦给点指导,最近一直在摸索,可是效果果断不行啊,各种感谢!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wujing91

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

请问楼上的有没有搞明白,同样求帮助
加油哦!
3楼2013-11-27 09:24:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

baimili

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

同求啊。。。没搞明白怎么用。。。
2楼2013-10-25 22:27:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一生为你

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

TCGA 中SNP的样本为什么会有四个txt?
有人知道这些名字的区别吗?是TCGA数据库的SNP数据
broad.mit.edu__Genome_Wide_SNP_6__TCGA-05-4244-01A-01D-1877-01__snp_analysis.hg18.seg.txt
broad.mit.edu__Genome_Wide_SNP_6__TCGA-05-4244-01A-01D-1877-01__snp_analysis.hg19.seg.txt
broad.mit.edu__Genome_Wide_SNP_6__TCGA-05-4244-01A-01D-1877-01__snp_analysis.nocnv_hg18.seg.txt
broad.mit.edu__Genome_Wide_SNP_6__TCGA-05-4244-01A-01D-1877-01__snp_analysis.nocnv_hg19.seg.txt
最后两个名字中nocnv代表什么意思
4楼2013-12-21 16:06:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yilin3201

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 一生为你 at 2013-12-21 16:06:45
TCGA 中SNP的样本为什么会有四个txt?
有人知道这些名字的区别吗?是TCGA数据库的SNP数据
broad.mit.edu__Genome_Wide_SNP_6__TCGA-05-4244-01A-01D-1877-01__snp_analysis.hg18.seg.txt
broad.mit.edu__Gen ...

1. hg18/hg19 are the name of different version of human genome.
2. "nocnv" just means that germline CN variations are removed. In TCGA, they ran SNP arrays on normal tissue too.
祈祷更好的一天,
5楼2015-02-25 02:01:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 澳大利亚 Murdoch University 全奖博士招生(3个名额)地质化工冶金领域 +17 AI8RaGaPaSCR 2026-08-07 18/900 2026-08-13 18:15 by 1oXDJgculBfW
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +6 医学老男孩 2026-08-13 13/650 2026-08-13 17:59 by yq199112088
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 28/1400 2026-08-13 17:51 by 医学老男孩
[文学芳草园] 阿姨 +3 汪汪锅 2026-08-09 3/150 2026-08-13 16:56 by 410610288
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +4 majunge000 2026-08-11 6/300 2026-08-13 16:50 by 四季常青藤
[基金申请] filecode +14 documentary 2026-08-10 16/800 2026-08-13 16:39 by 润生71
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 11/550 2026-08-13 10:40 by ZH远山
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
信息提示
请填处理意见