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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 大家发转录组和小RNA的文章，有要求提交数据么？怎么在NCBI上把测序的数据提交？
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园艺学童

铜虫 (小有名气)

[求助] 大家发转录组和小RNA的文章，有要求提交数据么？怎么在NCBI上把测序的数据提交？ 已有1人参与

最近投了一篇有关测序的文章，立马被拒了啊，说没有登录号，无法下载到原始的数据，写了好久，自认为还分析的不错，这么快就呗拒了，略不开心啊。。

大家发转录组和小RNA的文章，有要求提交数据么？怎么在NCBI上把测序的数据提交？
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1楼 2013-07-16 23:52:34
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fawn722

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验！ 2013-07-18 14:42:31
园艺学童: 金币+15, ★★★很有帮助 2013-07-19 16:32:43
一般杂志都要求有登录号，我碰到的都是让传好以后再发出去review。
转录组的数据可以传到GEO，很简单，填一个xls表格发到一个邮箱，把数据传到ftp就好了。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/seq.html

传SRA的稍微麻烦一点，要搞什么biosample和bioproject。
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2楼2013-07-18 10:03:10
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园艺学童

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by fawn722 at 2013-07-18 10:03:10
一般杂志都要求有登录号，我碰到的都是让传好以后再发出去review。
转录组的数据可以传到GEO，很简单，填一个xls表格发到一个邮箱，把数据传到ftp就好了。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/seq.html

传S ...

没有找到xls的表格下载呀？是自己建立填写么？
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3楼2013-07-19 12:01:04
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gengzhaolu

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by fawn722 at 2013-07-18 10:03:10
一般杂志都要求有登录号，我碰到的都是让传好以后再发出去review。
转录组的数据可以传到GEO，很简单，填一个xls表格发到一个邮箱，把数据传到ftp就好了。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/seq.html

传S ...

你好，请问如何下载到这个GEO的表格呢？
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每天进步一点！
4楼2014-11-18 15:33:36
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micro_lsp

捐助贵宾 (职业作家)

小小虫

【答案】应助回帖

如果是这个领域的内行专家审稿, 都会要求提交数据链接, NCBI上有个测序或芯片数据提交入口(NCBI’s Gene Expression Omnibus (GEO))。我当初发表小RNA文章时都是提交了数据链接的，如：MicroRNAs of Bombyx mori identified by Solexa
sequencing（http://www.biomedcentral.com/1471-2164/11/148）。祝你好运！
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Nothing is all.
5楼2015-08-07 08:30:40
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Thomas_T

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by fawn722 at 2013-07-18 10:03:10
一般杂志都要求有登录号，我碰到的都是让传好以后再发出去review。
转录组的数据可以传到GEO，很简单，填一个xls表格发到一个邮箱，把数据传到ftp就好了。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/seq.html

传S ...

你好，请问如果已经上传到GEO，获得的GSE开头的序列号能用于文章了吗？还是要用SRA的序列号？
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6楼2015-12-15 10:01:00
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顶你个球

金虫 (小有名气)

钻研，耐心，
楼主，你的数据提交好了吗？能否指教下，同是转录组数据提交，不是太懂。。。。
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7楼2016-01-25 15:48:49
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ray睿

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Thomas_T at 2015-12-15 10:01:00
你好，请问如果已经上传到GEO，获得的GSE开头的序列号能用于文章了吗？还是要用SRA的序列号？...

同样的问题，请问你是用的GSE还是SRA的序列号啊
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8楼2018-06-15 10:07:04
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